RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	DBH	P09172	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IRF2	P14316	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RAC2	P15153	192 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CRYBB2	P43320	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC15A1	P46059	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ENTPD1	P49961	510 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	BLVRA	P53004	296 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MS4A2	Q01362	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RIPK1	Q13546	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CRMP1	Q14194	572 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LNX2	Q8N448	690 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ST7L	Q8TDW4	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FEV	Q99581	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	MMP28	Q9H239	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	WDR76	Q9H967	626 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FAM183A	A6NL82	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	DCTN6	O00399	190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ACOT8	O14734	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ICMT	O60725	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TIPRL	O75663	272 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZFPL1	O95159	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HMGN1	P05114	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	S100A6	P06703	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	FCGR1A	P12314	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ANXA8	P13928	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SPI1	P17947	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	KITLG	P21583	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LMO1	P25800	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GSTT1	P30711	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GRK5	P34947	590 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CX3CR1	P49238	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PRKX	P51817	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HMGA2	P52926	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SLC25A1	P53007	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PAX2	Q02962	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PSG7	Q13046	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VARS-222	ENST00000470953	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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