RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 K7EPK0 472 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 IL33O95760 270 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 BPNT1O95861 308 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ERGIC1Q969X5 290 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 MAP3K3Q99759 626 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 MESP1Q9BRJ9 268 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 SCRT1Q9BWW7 348 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CERS4Q9HA82 394 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXO7Q9Y3I1 522 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 RP1P56715 2156 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 OR13C7P0DN81 318 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM33P57088 247 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TSLPQ969D9 159 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PFDN5Q99471 154 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TREM2Q9NZC2 230 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 EHFQ9NZC4 300 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ISG15P05161 165 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 HSD11B1P28845 292 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 OR3A2P47893 321 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM50BP56557 158 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 GUK1Q16774 197 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf140Q5VVS0 124 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 NPRL2Q8WTW4 380 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 EMC6Q9BV81 110 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PRODH2Q9UF12 536 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 C2orf72A6NCS6 295 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 UMAD1C9J7I0 102 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PLPP3O14495 311 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF205O95201 554 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CST4P01036 141 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 GP1BBP13224 206 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 MAS1LP35410 378 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 SULT1A1P50225 295 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC37A1P57057 533 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 C1QL4Q86Z23 238 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 YAF2Q8IY57 180 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PET100P0DJ07 73 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS2P15880 293 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 FPR2P25090 351 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PTGER4P35408 488 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 UCP2P55851 309 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF565Q8N9K5 539 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 PBOV1Q9GZY1 135 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 LMAN1LQ9HAT1 526 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM206AQ9NX38 181 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 MMP24Q9Y5R2 645 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CA3P07451 260 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 GLI4P10075 376 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF20P17024 532 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ITGA3P26006 1051 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 IL12BP29460 328 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB2AP61019 212 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 RHOVQ96L33 236 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 TOLLIPQ9H0E2 274 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-206ENST00000469947 CDC14BO60729 498 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC34A2O95436 690 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CRABP1P29762 137 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SNCAP37840 140 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB5CP51148 216 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SNU13P55769 128 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC26A5P58743 744 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms