RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	ENKUR	Q8TC29	256 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	PTX4	Q96A99	478 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GABARAP	H6UMI1	98 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CELA3B	P08861	270 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	VSIG8	P0DPA2	414 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	WNT5A	P41221	380 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	QRFP	P83859	136 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	UNC119	Q13432	240 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	KISS1	Q15726	138 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MTFR2	Q6P444	385 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	BEND4	Q6ZU67	534 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM46B	Q96A09	425 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	BOD1	Q96IK1	185 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GAL3ST1	Q99999	423 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	POFUT1	Q9H488	388 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OPA3	Q9H6K4	179 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CDH20	Q9HBT6	801 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB22A	Q9UL26	194 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FRY	Q5TBA9	3013 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0A6YYH2	397 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435		A6NJ64	397 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GMDS	O60547	372 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	NRAS	P01111	189 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	NGF	P01138	241 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	UBB	P0CG47	229 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GLI4	P10075	376 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PTHLH	P12272	177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PRKACB	P22694	351 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GDNF	P39905	211 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	P2RY6	Q15077	328 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT74	Q7RTS7	529 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OR52I2	Q8NH67	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OR51B6	Q9H340	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	STARD10	Q9Y365	291 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CACNG2	Q9Y698	323 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435		J3QW42	95 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CDC14B	O60729	498 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PFDN1	O60925	122 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CBR1	P16152	277 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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