RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM65Q6PI78 240 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 OR51E1Q8TCB6 317 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 GPR84Q9NQS5 396 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 OR6C68A6NDL8 312 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 I3L521 148 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SULT1B1O43704 296 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CSF3P09919 207 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CECR9P0C854 216 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SPHARQ15513 63 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 GABRA6Q16445 453 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 LIPNQ5VXI9 398 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 OR8H2Q8N162 312 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 OR4M2Q8NGB6 313 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 KCNK17Q96T54 332 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF98A6NK75 572 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 PRKYO43930 277 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 NRASP01111 189 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ALDH3B1P43353 468 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 EDDM3AQ14507 147 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 Q5PR19 223 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SPNS3Q6ZMD2 512 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 NOXA1Q86UR1 476 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF227Q86WZ6 799 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CDC20BQ86Y33 519 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 CD300LBA8K4G0 201 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 ADAM20O43506 726 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 MPZL1O95297 269 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 TUBG1P23258 451 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 AWAT2Q6E213 333 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PROK2Q9HC23 129 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 DIABLOQ9NR28 239 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 VNN3Q9NY84 501 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 TREM2Q9NZC2 230 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SZT2Q5T011 3432 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM212A6NML5 194 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PTTG1O95997 202 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 MAS1P04201 325 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 CLUP10909 449 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 TDGF1P3P51864 188 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 TRAM1Q15629 374 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 DGUOKQ16854 277 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 MESTQ5EB52 335 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 ST8SIA4Q92187 359 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 MRI1Q9BV20 369 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SLC16A6O15403 523 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 IFNA6P05013 189 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 COL4A2P08572 1712 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PGA4P0DJD7 388 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PGA3P0DJD8 388 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 HMGA2P52926 109 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 GNG3P63215 75 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF627Q7L945 461 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 OR8B2Q96RD0 313 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 SIGLEC11Q96RL6 698 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 NPAS1Q99742 590 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 GPR173Q9NS66 373 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 KCNS2Q9ULS6 477 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 EML5Q05BV3 1969 aa8.08□□□□□ -1.12
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF716A6NP11 495 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms