RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CD63	P08962	238 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CCL3	P10147	92 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		Q6ZSR3	168 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MOB3C	Q70IA8	216 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	KCTD9	Q7L273	389 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM123	Q8N131	208 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GHRL	Q9UBU3	117 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GPR132	Q9UNW8	380 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		V9GYS6	101 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FAM25E	A8MYX2	175 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZIC3	O60481	467 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	VAMP5	O95183	116 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NAT2	P11245	290 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	THBS4	P35443	961 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CBX5	P45973	191 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	KISS1	Q15726	138 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	THAP6	Q8TBB0	222 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GNRHR2	Q96P88	292 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR10A2	Q9H208	303 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	HOXA6	P31267	233 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PTGFR	P43088	359 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	M1AP	Q8TC57	530 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM230	Q96A57	120 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF75A	Q96N20	296 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1B0GW55	424 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR5H15	A6NDH6	313 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	BET1	O15155	118 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	WDPCP	O95876	746 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CRH	P06850	196 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DTX1	Q86Y01	620 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	UCN2	Q96RP3	112 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MBD2	Q9UBB5	411 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DUX4	Q9UBX2	424 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DHRS3	O75911	302 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SERPINF1	P36955	418 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	BEX5	Q5H9J7	111 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	STPG2	Q8N412	459 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SPERT	Q8NA61	448 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MR1	Q95460	341 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NMES1	Q9C002	83 aa		14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058		F5H5K5	113 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DHH	O43323	396 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PSMB6	P28072	239 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NPY4R	P50391	375 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SSR4	P51571	173 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	UBE2V2	Q15819	145 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RAET1L	Q5VY80	246 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		14.86	□□□□□ -0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		14.86	□□□□□ -0.03

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