RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 GCGP01275 180 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 PMP2P02689 132 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 CXCL1P09341 107 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 RAB35Q15286 201 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 SGCBQ16585 318 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 ST7LQ8TDW4 575 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.96□□□□□ -1.29
LMO3-208ENST00000441439 A0A0A6YYD4 124 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CEACAM5P06731 702 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 DAOP14920 347 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 IL2RGP31785 369 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 HSF1Q00613 529 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 PRDX4Q13162 271 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 ARL6IP1Q15041 203 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 WDR92Q96MX6 357 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 ZNF726A6NNF4 738 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 H3BQ15 152 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 PCCBP05166 539 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CT45A8P0DMV1 189 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CT45A9P0DMV2 189 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CEACAM1P13688 526 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 SLC6A8P48029 635 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 FUT7Q11130 342 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 GXYLT1Q4G148 440 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 TMEM156Q8N614 296 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 BCORP1Q8N888 145 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 S100PBPQ96BU1 408 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 RAB39BQ96DA2 213 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 WFDC1Q9HC57 220 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 FAM206AQ9NX38 181 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 H7C1Q1 480 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 AGPAT2O15120 278 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 APODP05090 189 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CSN2P05814 226 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 GNB3P16520 340 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CCL1P22362 96 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 PTGER4P35408 488 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CAMLGP49069 296 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 NPY4RP50391 375 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 DEFB134Q4QY38 66 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 TVP23CQ96ET8 276 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 NPIPB7O75200 414 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CLPSP04118 112 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 ADH5P11766 374 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 GPR3P46089 330 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CLDN6P56747 220 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 ERVFRD-1P60508 538 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 SPOCK1Q08629 439 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 FOXF1Q12946 379 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 PMS2P11Q13670 270 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 GAB4Q2WGN9 574 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-208ENST00000441439 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms