RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 ATF6P18850 670 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 HRH1P35367 487 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R2P41236 205 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 TAS2R19P59542 299 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 PITPNAQ00169 270 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 FZD2Q14332 565 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 MOGQ16653 247 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 KYAT1Q16773 422 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD22Q5VYY1 191 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM71AQ8IYT1 594 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC34Q8IZ02 419 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CA13Q8N1Q1 262 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 Q8N377 158 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 RORBQ92753 470 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 C18orf12Q96KH6 178 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 FCRL1Q96LA6 429 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM14Q96QK8 99 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGDIGQ99819 225 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 OSBPL11Q9BXB4 747 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 C1orf109Q9NX04 203 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 MUC3AQ02505 3323 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 LTBP1Q14766 1721 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 LAMA3Q16787 3333 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 EYSQ5T1H1 3165 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA6L10A6NI86 522 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 HIDE1A8MVS5 230 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF432O94892 652 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CFC1BP0CG36 223 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CFC1P0CG37 223 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 PET100P0DJ07 73 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 PGA4P0DJD7 388 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 PGA3P0DJD8 388 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 LIPCP11150 499 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-GP17693 338 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CEACAM3P40198 252 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEA3P43357 314 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 RGS6P49758 472 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 VBP1P61758 197 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ARFRP1Q13795 201 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 SPCS2Q15005 226 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 QPRTQ15274 297 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 EXOC3L4Q17RC7 722 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 BSXQ3C1V8 233 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 RESP18Q5W5W9 173 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 LCN12Q6JVE5 192 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 COX15Q7KZN9 410 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 OAFQ86UD1 273 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ITPRIPQ8IWB1 547 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 DAW1Q8N136 415 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CHST4Q8NCG5 386 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 FANK1Q8TC84 345 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 DOK4Q8TEW6 326 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM234Q8WY98 164 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ING5Q8WYH8 240 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 SGTBQ96EQ0 304 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00479Q96M42 142 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 KIR2DL4Q99706 377 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC19Q9H756 370 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A22Q9H936 323 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 GNB4Q9HAV0 340 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 C12orf10Q9HB07 376 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 CD274Q9NZQ7 290 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 DENND4AQ7Z401 1863 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF13BQ9NQT8 1826 aa3.55□□□□□ -1.84
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