RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 RAB19A4D1S5 217 aa7.4□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 SFTA3P0C7M3 94 aa7.4□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.4□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 ZNF141Q15928 474 aa7.4□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.4□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 CLCC1Q96S66 551 aa7.4□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.4□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.4□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 C1orf198Q9H425 327 aa7.4□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.4□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 HPP00738 406 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 IL5P05113 134 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 PPICP45877 212 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 CAPZBP47756 277 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 UNC119Q13432 240 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 GKN2Q86XP6 184 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 R4GMQ9 66 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 A0A1W2PPE2 198 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 ZNF44P15621 663 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 FCGR2CP31995 323 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 ZXDAP98168 799 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 MYBPHQ13203 477 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 TCTN2Q96GX1 697 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 MUC3AQ02505 3323 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 A0A096LPE4 126 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 A0A1W2PPZ6 126 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 TMEM218A2RU14 115 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.39□□□□□ -1.23
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SNX13-201ENST00000409076 IL33O95760 270 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 CD53P19397 219 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 MPGP29372 298 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 F2RL1P55085 397 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 RSU1Q15404 277 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 CEBPEQ15744 281 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 SULF2Q8IWU5 870 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 TMEM123Q8N131 208 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 OR8U1Q8NH10 309 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 FNDC9Q8TBE3 224 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 SLC46A1Q96NT5 459 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 RAB33BQ9H082 229 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.39□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 ZNF98A6NK75 572 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 PLPP3O14495 311 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 ZNF217O75362 1048 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 B3GALNT1O75752 331 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 RAD51DO75771 328 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 IFNA21P01568 189 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 BGLAPP02818 100 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 GALP22466 123 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 HSD17B7P56937 341 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 HFEQ30201 348 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.38□□□□□ -1.23
SNX13-201ENST00000409076 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.38□□□□□ -1.23
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