RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 DIRAS2Q96HU8 199 aa17.34■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 WDFY2Q96P53 400 aa17.34■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 CNTD2Q9H8S5 307 aa17.34■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 HMG20AQ9NP66 347 aa17.34■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 STEAP1Q9UHE8 339 aa17.34■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 DHRS7CA6NNS2 312 aa17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 SLC17A2O00624 439 aa17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 GMDSO60547 372 aa17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 PPP1CBP62140 327 aa17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 TMEM255AQ5JRV8 349 aa17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 CNIH2Q6PI25 160 aa17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 PP6455Q8WZ26 134 aa17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 RFT1Q96AA3 541 aa17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 ABRACLQ9P1F3 81 aa17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
ODC1-202ENST00000405333 ICMTO60725 284 aa17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 HCKP08631 526 aa17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 GRNP28799 593 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 PSMD7P51665 324 aa17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 RAB11BQ15907 218 aa17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 SPANXN2Q5MJ10 180 aa17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 NKAIN3Q8N8D7 197 aa17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 OR1J1Q8NGS3 322 aa17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 S100ZQ8WXG8 99 aa17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A38Q96DW6 304 aa17.33■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 MEGF11A6BM72 1044 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 THBDP07204 575 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 HTR2CP28335 458 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 CHRNB4P30926 498 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 NAAAQ02083 359 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 TMEM42Q69YG0 159 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 OR2T2Q6IF00 324 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 UTS2BQ765I0 119 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 FAM169BQ8N8A8 192 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 SLC25A40Q8TBP6 338 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 UBASH3BQ8TF42 649 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 SSC4DQ8WTU2 575 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 PIGCQ92535 297 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 C10orf35Q96D05 121 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 GPR160Q9UJ42 338 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 SPATA2Q9UM82 520 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 PLCE1Q9P212 2302 aa17.32■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 GGT3PA6NGU5 568 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 FAM25AB3EWG3 89 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 FAM25CB3EWG5 89 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 FAM25GB3EWG6 89 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 CFPP27918 469 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ETV6P41212 452 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 EVX1P49640 407 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 EFNB2P52799 333 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ZNF846Q147U1 533 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ZNF79Q15937 498 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ALKBH6Q3KRA9 238 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 CCDC54Q8NEL0 328 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 OR5D18Q8NGL1 313 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 CMBLQ96DG6 245 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 FZR1Q9UM11 496 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 CD300LBA8K4G0 201 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ZNF850A8MQ14 1090 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 NRASP01111 189 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 MPV17P39210 176 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 OR3A4PP47883 348 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 POU3F4P49335 361 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 C1orf100Q5SVJ3 147 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 OR10K2Q6IF99 312 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 OR5L1Q8NGL2 311 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 FAM3DQ96BQ1 224 aa17.31■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 KISS1Q15726 138 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 C2orf76Q3KRA6 126 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 CLVS2Q5SYC1 327 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 BIVMQ86UB2 503 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 WFDC8Q8IUA0 241 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 OR4M1Q8NGD0 313 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 OR6M1Q8NGM8 313 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ZFAND2BQ8WV99 257 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 COQ3Q9NZJ6 369 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 EXTL2Q9UBQ6 330 aa17.3■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ICE1Q9Y2F5 2266 aa17.29■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 CALCBP10092 127 aa17.29■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ASCL1P50553 236 aa17.29■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 FAM131AQ6UXB0 335 aa17.29■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 CMTM4Q8IZR5 234 aa17.29■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 SORCS2Q96PQ0 1159 aa17.29■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 CYSLTR2Q9NS75 346 aa17.29■□□□□ 0.36
ODC1-202ENST00000405333 ROS1P08922 2347 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms