RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 PPP1R1AQ13522 171 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ALKAL2Q6UX46 152 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 FAM57BQ71RH2 274 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 COQ8AQ8NI60 647 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ST8SIA2Q92186 375 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 SPTSSAQ969W0 71 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 GPER1Q99527 375 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 TM2D1Q9BX74 207 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 OR10A2Q9H208 303 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 KCNMB2Q9Y691 235 aa11.48□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 DHHO43323 396 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 HPP00738 406 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 COX6A1P12074 109 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ICAM2P13598 275 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ABOP16442 354 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 GFOD2Q3B7J2 385 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 CARD17Q5XLA6 110 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 TMEM185BQ9H7F4 350 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 RAB18Q9NP72 206 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 RASL12Q9NYN1 266 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 TTC28Q96AY4 2481 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ZNF814B7Z6K7 855 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 FPR2P25090 351 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 PTGFRP43088 359 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 SGCAQ16586 387 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 LPAL2Q16609 132 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 TMEM123Q8N131 208 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 GVQW1Q8N7I0 195 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ZBTB44Q8NCP5 570 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 OR9K2Q8NGE7 335 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 RELTQ969Z4 430 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 MRGPRFQ96AM1 343 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 CMBLQ96DG6 245 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 CHST5Q9GZS9 411 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 DKKL1Q9UK85 242 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 GPR132Q9UNW8 380 aa11.47□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 CFAP54Q96N23 3096 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 OR2AT4A6NND4 320 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 CSN2P05814 226 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 UMODP07911 640 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 CPT2P23786 658 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 MLF1P58340 268 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 NAAAQ02083 359 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 KISS1Q15726 138 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 FAM27BQ5VT28 67 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 STPG2Q8N412 459 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 BVESQ8NE79 360 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 PXT1Q8NFP0 134 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 MR1Q95460 341 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 POM121Q96HA1 1249 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 S100A13Q99584 98 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 HPF1Q9NWY4 346 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.46□□□□□ -0.57
PRAME-203ENST00000402697 B4E171 279 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 ZIC3O60481 467 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 PSMB6P28072 239 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 TSPAN7P41732 249 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 OR3A4PP47883 348 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 STARP49675 285 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 RAC3P60763 192 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 PLAC9Q5JTB6 97 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 OR52W1Q6IF63 320 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 DRAM2Q6UX65 266 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 MOB3CQ70IA8 216 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.45□□□□□ -0.58
PRAME-203ENST00000402697 TMEM156Q8N614 296 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms