RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376959.6

KCNC3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene KCNC3, Length 5,447 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3-201ENST00000376959 HLA-CQ95604 372 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 HCSTQ9UBK5 93 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 UPK1AO00322 258 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 ICOSLGO75144 302 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 UQCC1Q9NVA1 299 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 POM121BA6NF01 834 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 PGA3P0DJD8 388 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 FUT6P51993 359 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 RNF24Q9Y225 148 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 WNT1P04628 370 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 ATF1P18846 271 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 CD200P41217 278 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 HEXAP06865 529 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 BTNL3Q6UXE8 466 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MORN4Q8NDC4 146 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 TRAV34A0A0B4J273 112 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 IRS1P35568 1242 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 SPCS3P61009 180 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 DPTQ07507 201 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 IGSF11Q5DX21 431 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 PP6455Q8WZ26 134 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 FZD2Q14332 565 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 PYCR3Q53H96 274 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 XAF1Q6GPH4 301 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 GALMQ96C23 342 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 FAM166BA8MTA8 275 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 SLC6A1P30531 599 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 POM121L2Q96KW2 1035 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 FGF22Q9HCT0 170 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 FIGNL2A6NMB9 653 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 GYPAP02724 150 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 SLC16A13Q7RTY0 426 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 OR6S1Q8NH40 331 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 OR2T6Q8NHC8 308 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MRGPRX4Q96LA9 322 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 FCN1O00602 326 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 AGERQ15109 404 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 CA13Q8N1Q1 262 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 SFT2D2O95562 160 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 OR1D5P58170 312 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MENTQ9BUN1 341 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 LY86O95711 162 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 C16orf52Q8NHV5 167 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 LRRC3CA6NJW4 275 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 K7ESM1 405 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 RAB7AP51149 207 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 CLDN15P56746 228 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 GSG1Q2KHT4 349 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 OR5AL1P0C617 328 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 EMDP50402 254 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 DHRS2Q13268 280 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 RAB40CQ96S21 281 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MTFP1Q9UDX5 166 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 A0A1B0GTQ1 180 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 PMS2P1A4D2B8 440 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 HMSDA8MTL9 139 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 GP1BAP07359 652 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 FFAR4Q5NUL3 377 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 WDR73Q6P4I2 378 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 SULT1A2P50226 295 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 ONECUT2O95948 504 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 FUT3P21217 361 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 H0YIG0 161 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 CD96P40200 585 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNC3-201ENST00000376959 PNLIPRP2P54317 469 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms