RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365434.1

RNU6-1130P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1130, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1130P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CCR1P32246 355 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SERPINB8P50452 374 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PRR3P79522 188 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 HOXC5Q00444 222 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 RUNX1Q01196 453 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 NCF4Q15080 339 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LGALS9CQ6DKI2 356 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TMEM144Q7Z5S9 345 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR11H6Q8NGC7 330 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR4D5Q8NGN0 318 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PLAC4Q8WY50 150 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MS4A8Q9BY19 250 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 NPTNQ9Y639 398 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TET1Q8NFU7 2136 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 DOCK3Q8IZD9 2030 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 DENND4AQ7Z401 1863 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SMIM26A0A096LP01 95 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 A0A0G2JQZ4 141 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 A0A1W2PPM0 123 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CD3DP04234 171 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CD2P06729 351 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 KITLGP21583 273 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CLDN6P56747 220 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 GUSBP1Q15486 140 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SPINK9Q5DT21 86 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MLIPQ5VWP3 458 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LRRC66Q68CR7 880 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SLC38A6Q8IZM9 456 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ZNF439Q8NDP4 499 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR52B4Q8NGK2 314 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 KCNG3Q8TAE7 436 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CXorf40AQ8TE69 158 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TMEM186Q96B77 213 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SLC41A3Q96GZ6 507 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OMDQ99983 421 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 FANCEQ9HB96 536 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LRRK2Q5S007 2527 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 NCKAP5O14513 1909 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MYO7AQ13402 2215 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 A0A0C4DFX4 3053 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SYCE3A1L190 88 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 UPK2O00526 184 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 NEBLO76041 1014 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 KDELR1P24390 212 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 IL12BP29460 328 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SPRR2AP35326 72 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PCK1P35558 622 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 RND2P52198 227 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 RPS23P62266 143 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ACTG2P63267 376 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 RPA4Q13156 261 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CHIT1Q13231 466 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 SLC36A3Q495N2 470 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 IYDQ6PHW0 289 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LYZL2Q7Z4W2 148 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 HS3ST5Q8IZT8 346 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 RHEBL1Q8TAI7 183 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PTP4A1Q93096 173 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 PPP1R36Q96LQ0 422 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 KCNS3Q9BQ31 491 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 C20orf144Q9BQM9 153 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 TOLLIPQ9H0E2 274 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 LRRN3Q9H3W5 708 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MEAF6Q9HAF1 191 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 NAGKQ9UJ70 344 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ASB3Q9Y575 518 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 NBEAQ8NFP9 2946 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 MT-ATP6P00846 226 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OPN1SWP03999 348 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 ATP5DP30049 168 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 RWDD2BP57060 319 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 OR4F3Q6IEY1 312 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-1130P-201ENST00000365434 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa-1.06□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms