RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 KDM4DQ6B0I6 523 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q6ZSR6 202 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ORMDL3Q8N138 153 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GABRG1Q8N1C3 465 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 JAGN1Q8N5M9 183 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00469Q8N7U9 141 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC25A29Q8N8R3 303 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC26A10Q8NG04 563 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR52N1Q8NH53 320 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR51F2Q8NH61 342 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM81AQ8TBF8 368 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB1CQ92928 201 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSDMAQ96QA5 445 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEAD3Q99594 435 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CALN1Q9BXU9 219 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM192AQ9GZU8 254 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIGUQ9H490 435 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 NMRK1Q9NWW6 199 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 GCNT4Q9P109 453 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF492Q9P255 531 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 RWDD2AQ9UIY3 292 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 MMACHCQ9Y4U1 282 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 R4GN34 69 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 INSRP06213 1382 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR14LQ5THK1 2151 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLXNB1O43157 2135 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 A8MWL6 223 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CENPBD1B2RD01 187 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCELO95171 688 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV1-39P01597 117 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 HLA-HP01893 362 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV1D-39P04432 117 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB5AP20339 215 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTMSP20962 102 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMOX2P30519 316 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 APLNRP35414 380 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGM4P49221 684 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFRSF9Q07011 255 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 MERTKQ12866 999 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITIH4Q14624 930 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPANXN2Q5MJ10 180 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFSD14CQ5VZR4 134 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMARCD3Q6STE5 483 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM131AQ6UXB0 335 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR82Q6UXN9 313 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 LUZP2Q86TE4 346 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PQLC3Q8N755 202 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 MCUR1Q96AQ8 359 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 PKMYT1Q99640 499 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 EMC6Q9BV81 110 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 CA10Q9NS85 328 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAS2R1Q9NYW7 299 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-227P-201ENST00000362865 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa1.03□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ISPDA4D126 451 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC169A6NNP5 214 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF878C9JN71 531 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 J3QRE1 110 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCKDKO14874 412 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 NACADO15069 1562 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC22O60826 627 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTNSO60931 367 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 FCN3O75636 299 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TDP2O95551 362 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAS1P04201 325 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 IFNW1P05000 195 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 HLA-DMAP28067 261 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC1A2P43004 574 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR1G1P47890 313 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF33AQ06730 810 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF678Q5SXM1 525 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 MROH7Q68CQ1 1323 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZFAND6Q6FIF0 208 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM53Q6P2H8 277 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB43Q86YS6 212 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 BBS7Q8IWZ6 715 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4M2Q8NGB6 313 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM19A4Q96LR4 140 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR21Q99679 349 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 SFXN3Q9BWM7 321 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 MS4A8Q9BY19 250 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF302Q9NR11 478 aa1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms