RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF43P17038 809 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGDIBP52566 201 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SLC9A3R2Q15599 337 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 Q7L0L9 218 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ESX1Q8N693 406 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR2M3Q8NG83 312 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PAQR8Q8TEZ7 354 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CYTL1Q9NRR1 136 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 GHRLQ9UBU3 117 aa16.09■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PP11 408 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF814B7Z6K7 855 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 H0YIZ8 118 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 QDPRP09417 244 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 PET100P0DJ07 73 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 CD79AP11912 226 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 GFOD2Q3B7J2 385 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SLC22A8Q8TCC7 542 aa16.08■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 AQP7P3A6NL99 342 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF726A6NNF4 738 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ADAP1O75689 374 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 OR2J2O76002 312 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 OPN1LWP04000 364 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 NR2C1P13056 603 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 OR3A2P47893 321 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM71Q6P5X7 295 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 OR13G1Q8NGZ3 307 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 AQP10Q96PS8 301 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 TIAF1O95411 115 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ACTL6AO96019 429 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 PRF1P14222 555 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ANOS1P23352 680 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ALDH3B1P43353 468 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ECH1Q13011 328 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 STK11Q15831 433 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 DRAM2Q6UX65 266 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 TMED6Q8WW62 240 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ROBO4Q8WZ75 1007 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 MMP26Q9NRE1 261 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 MTCH2Q9Y6C9 303 aa16.07■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 GPR31O00270 319 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SIGLEC6O43699 453 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SCRG1O75711 98 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 CTSSP25774 331 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 EIF1P41567 113 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SLC6A9P48067 706 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD55Q3KP44 614 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 AADACL3Q5VUY0 350 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 OR6C1Q96RD1 312 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 NDUFA2O43678 99 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ADCYAP1P18509 176 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 PI3P19957 117 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ADH6P28332 368 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SFTPDP35247 375 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 PTGFRP43088 359 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 LSM6P62312 80 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SCRN3Q0VDG4 424 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 KISS1Q15726 138 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 PGAM5Q96HS1 289 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 C2orf50Q96LR7 162 aa16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 MSGN1A6NI15 193 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 RAMP1O60894 148 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 IGLV3-1P01715 115 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 H2AFB1P0C5Y9 115 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 THBS4P35443 961 aa16.05■□□□□ 0.16
SPNS3-201ENST00000355530 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms