RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339711.8

PRDM8-201, Transcript of PR/SET domain 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM8, Length 4,095 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8-201ENST00000339711 OR5H14A6NHG9 310 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 K7EPK0 472 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 SERPINE2P07093 398 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 COX6A1P12074 109 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 GNB3P16520 340 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 MST1P26927 711 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 CLINT1Q14677 625 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 SLC10A1Q14973 349 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 OR52W1Q6IF63 320 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 LYPD8Q6UX82 237 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 FJX1Q86VR8 437 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 GPR87Q9BY21 358 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 TXNL1O43396 289 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 PMS2P2O95744 297 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 PLAURQ03405 335 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZP4Q12836 540 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 RHEBQ15382 184 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 CMBLQ96DG6 245 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 MS4A18H0YCH9 400 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 LPLP06858 475 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ARL6IP1Q15041 203 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 MS4A18Q3C1V0 323 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 UCN2Q96RP3 112 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 B4GALT1P15291 398 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 IL32P24001 234 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 CRLF2Q9HC73 371 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF709Q8N972 641 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ST8SIA4Q92187 359 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 BIN3Q9NQY0 253 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 AQP7P3A6NL99 342 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 AQP8O94778 261 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 HPXP02790 462 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 RAC3P60763 192 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ECH1Q13011 328 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 OR10D3Q8NH80 312 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 FOXK1P85037 733 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 TGFBR3Q03167 851 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 TRILQ7L0X0 811 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 APH1AQ96BI3 265 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 C20orf24Q9BUV8 137 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 UPK3AO75631 287 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 OR4E1P0C645 316 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 HRH1P35367 487 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 PRSS12P56730 875 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 YIPF5Q969M3 257 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 CMTM3Q96MX0 182 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 NELFAQ9H3P2 528 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 MPDZO75970 2070 aa14.62□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 C21orf140B9A014 251 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 APLNRP35414 380 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 SVBPQ8N300 66 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF519Q8TB69 540 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 LRRC46Q96FV0 321 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZFP82Q8N141 532 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 XRCC3O43542 346 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 NAT2P11245 290 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ABOP16442 354 aa14.61□□□□□ -0.07
PRDM8-201ENST00000339711 ACP1P24666 158 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms