RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 CHST5Q9GZS9 411 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 LOXL2Q9Y4K0 774 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 LOC100509620A0A075B734 347 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 M0R135 149 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 HPP00738 406 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 P04436 131 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 NAT2P11245 290 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 HLA-GP17693 338 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 GMFBP60983 142 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB14P61106 215 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 KISS1Q15726 138 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 UBE2V2Q15819 145 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM27BQ5VT28 67 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 DBX2Q6ZNG2 339 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 C1QL2Q7Z5L3 287 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC28AQ8IWP9 274 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF799Q96GE5 643 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ADGRG7Q96K78 797 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PADI1Q9ULC6 663 aa18.2■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 C9orf170A2RU37 121 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF716A6NP11 495 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PMP2P02689 132 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 RFPL3SP0C7P2 107 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 FAHP16930 419 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 CRYGSP22914 178 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF84P51523 738 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 MICBQ29980 383 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 HOGA1Q86XE5 327 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 FAHD2AQ96GK7 314 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 DOCK10Q96BY6 2186 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 MPGP29372 298 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 AANATQ16613 207 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 OR56B1Q8NGI3 324 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 OR5D18Q8NGL1 313 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 OR4K15Q8NH41 348 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 MITD1Q8WV92 249 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNE4Q8WWG9 221 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC39A7Q92504 469 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 DEPPQ9NTK1 212 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PLEK2Q9NYT0 353 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 MUC3AQ02505 3323 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 CCSO14618 274 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 SHOXO15266 292 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 CALCRP30988 508 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PTGFRP43088 359 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 SNAI3Q3KNW1 292 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 VAX1Q5SQQ9 334 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 GSG1LQ6UXU4 331 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 DEFB123Q8N688 67 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ESX1Q8N693 406 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 NPRL2Q8WTW4 380 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PP6455Q8WZ26 134 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXW5Q969U6 566 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 GHRLQ9UBU3 117 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 EFSO43281 561 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 NMBP08949 121 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ICAM2P13598 275 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR137CQ8N3F9 429 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 OR14L1PQ8NHC6 308 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ST8SIA4Q92187 359 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 OCSTAMPQ9BR26 566 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 MFFQ9GZY8 342 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 OR10A2Q9H208 303 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PDGFAP04085 211 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF883P0CG24 379 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 TCN2P20062 427 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM189A2Q15884 450 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ACER2Q5QJU3 275 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM65Q6PI78 240 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ALKAL2Q6UX46 152 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC16A14Q7RTX9 510 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 OR6K3Q8NGY3 331 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 SCARB1Q8WTV0 552 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 C10orf35Q96D05 121 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 ARPC5LQ9BPX5 153 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 PIGLQ9Y2B2 252 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC187A0A096LP49 1063 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 OR5H14A6NHG9 310 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 CEACAM18A8MTB9 384 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 STMND1H3BQB6 276 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-202ENST00000335475 I3L521 148 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms