RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 AQP3Q92482 292 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 C20orf85Q9H1P6 137 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 GLRX2Q9NS18 164 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 MCUBQ9NWR8 336 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 A8MV72 311 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 OR3A2P47893 321 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 GSK3AP49840 483 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 RNF170Q96K19 258 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 SPTBN4Q9H254 2564 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 LAMA5O15230 3695 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0A6YYJ9 748 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 MEIS3P1A6NDR6 274 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 XRCC2O43543 280 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 MPGP29372 298 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 ARR3P36575 388 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 ALDH3B1P43353 468 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF260Q3ZCT1 412 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 GHRLQ9UBU3 117 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 MSRB2Q9Y3D2 182 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 WIPF3A6NGB9 483 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TNK1Q13470 666 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 FAAP20Q6NZ36 180 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 COLCA1Q6ZS62 124 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CDH24Q86UP0 819 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 LPAR5Q9H1C0 372 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 PLSCR2Q9NRY7 297 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CDC14BO60729 498 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 GTF2F2P13984 249 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 EDN3P14138 238 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 PTGFRP43088 359 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 DMRTC1Q5HYR2 192 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM53Q6P2H8 277 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZTK2 550 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM104Q8NE00 496 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 OR4C16Q8NGL9 310 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 OR1K1Q8NGR3 316 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 SPSB1Q96BD6 273 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 SARAFQ96BY9 339 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 GHITMQ9H3K2 345 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 NOX3Q9HBY0 568 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 GPR173Q9NS66 373 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CEP295Q9C0D2 2601 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 LOC100509620A0A075B734 347 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM235A6NFC5 223 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 MPIG6BO95866 241 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CHRM2P08172 466 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 AKAIN1P0CW23 69 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 NAT2P11245 290 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CD79AP11912 226 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 VEGFCP49767 419 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 FAM3AP98173 230 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 FAM189A2Q15884 450 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 DPPA2Q7Z7J5 298 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 OR10R2Q8NGX6 335 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 PIGTQ969N2 578 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 SPSB4Q96A44 273 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CMBLQ96DG6 245 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM59Q9BXS4 323 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 WISP2O76076 250 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 IL18BPO95998 194 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF92Q03936 586 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 OR8B8Q15620 311 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 GSG1Q2KHT4 349 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CHST4Q8NCG5 386 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TRIB1Q96RU8 372 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 PEX14O75381 377 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 MELTFP08582 738 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00303Q3SY05 128 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM42Q69YG0 159 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM229BQ8NBD8 167 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 NEK6Q9HC98 313 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 MED12LQ86YW9 2145 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R19P59542 299 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 RAB1AP62820 205 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CDNFQ49AH0 187 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CLVS2Q5SYC1 327 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 OR5D18Q8NGL1 313 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 GIMAP1Q8WWP7 306 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 TAAR6Q96RI8 345 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 NICN1Q9BSH3 213 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 CST11Q9H112 138 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 FRYQ5TBA9 3013 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0A6YYD4 124 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 NDUFB6O95139 128 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 PRKACBP22694 351 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD8-201ENST00000313173 STOMP27105 288 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms