RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 CALCBP10092 127 aa9.57□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 CDK2P24941 298 aa9.57□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 ACKR3P25106 362 aa9.57□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 TRIQKQ629K1 86 aa9.57□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 SIAH3Q8IW03 269 aa9.57□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.57□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.57□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 RNF122Q9H9V4 155 aa9.57□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 POM121CA8CG34 1229 aa9.56□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 NGFP01138 241 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 TBR1Q16650 682 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZS92 163 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 BHLHE23Q8NDY6 225 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 ABRACLQ9P1F3 81 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 KLK11Q9UBX7 282 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.56□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.56□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa9.55□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 RAB35Q15286 201 aa9.55□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 GON7Q9BXV9 100 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.55□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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GGPS1-201ENST00000282841 DKK4Q9UBT3 224 aa9.55□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.55□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa9.54□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.54□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 C1QTNF9P0C862 333 aa9.54□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 EDN3P14138 238 aa9.54□□□□□ -0.88
GGPS1-201ENST00000282841 BDKRB2P30411 391 aa9.54□□□□□ -0.88
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