RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 RAB40CQ96S21 281 aa7.22□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 C12orf49Q9H741 205 aa7.22□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 CRXO43186 299 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 ICOSLGO75144 302 aa7.22□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 OR5H8P0DN80 308 aa7.22□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 RFC3P40938 356 aa7.22□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF154Q13106 437 aa7.22□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.22□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 POMT2Q9UKY4 750 aa7.22□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 F11P03951 625 aa7.22□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 DRAM2Q6UX65 266 aa7.22□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.22□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.22□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 CD1CP29017 333 aa7.22□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 PNLIPRP2P54317 469 aa7.22□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 MANBALQ9NQG1 85 aa7.21□□□□□ -1.25
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LIMD1-201ENST00000273317 DEFB103AP81534 67 aa7.21□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.21□□□□□ -1.25
LIMD1-201ENST00000273317 TRAV34A0A0B4J273 112 aa7.21□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM207Q6UWW9 146 aa7.21□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 FITM1A5D6W6 292 aa7.21□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 G3V3Y1 287 aa7.21□□□□□ -1.26
LIMD1-201ENST00000273317 SIRPB1O00241 398 aa7.21□□□□□ -1.26
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