RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ACOXLQ9NUZ1 547 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa18.75■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 DAPL1A0PJW8 107 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FAM157AC9JC47 383 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 GZMKP49863 264 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 RAB40BQ12829 278 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 IL18R1Q13478 541 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 PRSS35Q8N3Z0 413 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 SPERTQ8NA61 448 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FBLIM1Q8WUP2 373 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ERGIC1Q969X5 290 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ITPKCQ96DU7 683 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 PSMB10P40306 273 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 KIR3DL2P43630 455 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 GALEQ14376 348 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 BCL2L15Q5TBC7 163 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 LHFPL3Q86UP9 236 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 OR14K1Q8NGZ2 314 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 TIMD4Q96H15 378 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 UFSP2Q9NUQ7 469 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 GNG8Q9UK08 70 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa18.74■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ZNF850A8MQ14 1090 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 INAFM1C9JVW0 142 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 IFNL4K9M1U5 179 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 P2RY10O00398 339 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FADS2O95864 444 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1B1P15313 513 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 CCL1P22362 96 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 MAP2K3P46734 347 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 CDH15P55291 814 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ZMYND11Q15326 602 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 WDR38Q5JTN6 314 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FAM201AQ5SY85 155 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ITFG2Q969R8 447 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ERVK13-1Q9NX77 482 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 MPC1Q9Y5U8 109 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 V9GYS6 101 aa18.73■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 H0YJX3 145 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ZNF205O95201 554 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 IGHV2-5P01817 119 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 LIMS3P0CW19 117 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 LIMS4P0CW20 117 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 AQP4P55087 323 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 BTG1P62324 171 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 PRDX4Q13162 271 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 KLHL22Q53GT1 634 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FAM76BQ5HYJ3 339 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FDX2Q6P4F2 183 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 SETD9Q8NE22 299 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 HPSE2Q8WWQ2 592 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 OR5P3Q8WZ94 311 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 PIGCQ92535 297 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 PELI1Q96FA3 418 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 JAM3Q9BX67 310 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ZNF665Q9H7R5 613 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 TMEM165Q9HC07 324 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 YAE1D1Q9NRH1 226 aa18.72■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 DHRS3O75911 302 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 GRPP07492 148 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 THBS2P35442 1172 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 RIPK1Q13546 671 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ZNF826PQ6ZT77 177 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 OR1M1Q8NGA1 313 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 OR2G2Q8NGZ5 317 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 C4orf36Q96KX1 117 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ALG8Q9BVK2 526 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 TLNRD1Q9H1K6 362 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 INPP5EQ9NRR6 644 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 FRRS1LQ9P0K9 344 aa18.71■□□□□ 0.59
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 J3QLW9 94 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 FSTL3O95633 263 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 FAHP16930 419 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 ZNF19P17023 458 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 ZNF154Q13106 437 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 SNCBQ16143 134 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 ODF4Q2M2E3 257 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 TMEM155Q4W5P6 130 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 DMRTC1Q5HYR2 192 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB37Q5TC79 503 aa18.7■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 TMEM42Q69YG0 159 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms