RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A TAX4P47030 604 aa3.97□□□□□ -1.77
YHL009W-AYHL009W-A YGR151CP53287 111 aa3.97□□□□□ -1.77
YHL009W-AYHL009W-A CIT1P00890 479 aa3.96□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A RSP5P39940 809 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A GET2P40056 285 aa3.96□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A MEP2P41948 499 aa3.96□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A YGR125WP53273 1036 aa3.96□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A YDR338CQ05497 695 aa3.96□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A ABF1P14164 731 aa3.95□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A TAF8Q03750 510 aa3.95□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A RAD4P14736 754 aa3.94□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A RNR1P21524 888 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A PEX1P24004 1043 aa3.94□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A YFL052WP43551 465 aa3.94□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A ASN1P49089 572 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A STP1Q00947 519 aa3.94□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A REC102Q02721 264 aa3.94□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A ULA1Q12059 462 aa3.94□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A PHO5P00635 467 aa3.93□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A MIP6P38760 659 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A MIT1P40002 666 aa3.93□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A HFD1Q04458 532 aa3.93□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A GEP3Q08622 556 aa3.93□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A CCT5P40413 562 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A TY4A-JP47023 414 aa3.92□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A YDL086WQ07505 273 aa3.92□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A BET3P36149 193 aa3.91□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A YHR097CP38809 366 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A BNA2P47125 453 aa3.91□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A NMA2P53204 395 aa3.91□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A COX18P53239 316 aa3.91□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A YPL068CQ02749 293 aa3.91□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YHL009W-AYHL009W-A MBR1P23493 339 aa3.9□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A BCS1P32839 456 aa3.9□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A PIG2P40187 538 aa3.9□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A TIM54P47045 478 aa3.9□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A HMO1Q03973 246 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A MDM20Q12387 796 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A Q0142Q9ZZW4 58 aa3.9□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A LAM4P38800 1345 aa3.9□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A PRP28P23394 588 aa3.89□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A HOT13P36078 116 aa3.89□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A BIT2P38346 545 aa3.89□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A PSA1P41940 361 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A ECM3Q99252 613 aa3.89□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A APL3P38065 1025 aa3.88□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A NPY1P53164 384 aa3.88□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A RAD18P10862 487 aa3.87□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A STE4P18851 423 aa3.87□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A ORM2Q06144 216 aa3.87□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A THI22Q06490 572 aa3.87□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A FLC1Q08967 793 aa3.87□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa3.87□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A TPK2P06245 380 aa3.86□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A PMT6P42934 759 aa3.86□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A RSC8P43609 557 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A RPN10P38886 268 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A YNL195CP40168 261 aa3.85□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A MPS3P47069 682 aa3.85□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A RTA1P53047 317 aa3.85□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A CTP1P38152 299 aa3.84□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A YHR020WP38708 688 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A KHA1P40309 873 aa3.84□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
YHL009W-AYHL009W-A CAN1P04817 590 aa3.83□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A AAD3P25612 363 aa3.83□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A GID8P40208 455 aa3.83□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A IRC8P47046 822 aa3.83□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A DIP5P53388 608 aa3.83□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A NGL2Q03264 515 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A ARG7Q04728 441 aa3.83□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A RKI1Q12189 258 aa3.83□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A FEN2P25621 512 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A YDR179W-AQ03983 463 aa3.82□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A RPN7Q06103 429 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A VPS36Q06696 566 aa3.82□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A VBA3P25594 458 aa3.81□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A SEC6P32844 805 aa3.81□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A MTC2P34246 357 aa3.81□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A MCD4P36051 919 aa3.81□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A YKR051WP36142 418 aa3.81□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A RFX1P48743 811 aa3.81□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A PIP2P52960 996 aa3.81□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A ECM32P32644 1121 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A BEM3P32873 1128 aa3.8□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A PAM1P37304 830 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A SNU71P53207 620 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A ATP23P53722 227 aa3.8□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A IRC3Q06683 689 aa3.8□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A NTH1P32356 751 aa3.79□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A EUG1P32474 517 aa3.79□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A YIL077CP40508 320 aa3.79□□□□□ -1.8
YHL009W-AYHL009W-A PCL10P53124 433 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.9 ms