RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637955.1

ATP6AP2-231, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 2, human

TSL 5

Gene ATP6AP2, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FAM13A	O94988	1023 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ARHGAP4	P98171	946 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	GAS6	Q14393	721 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TET3	O43151	1660 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CD33	P20138	364 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ARSD	P51689	593 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CTBS	Q01459	385 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	GPR152	Q8TDT2	470 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	EID1	Q9Y6B2	187 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ERVK-7	P63135	1459 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FZD6	O60353	706 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	AAMP	Q13685	434 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FGFR3	P22607	806 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	HSPA2	P54652	639 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	C2CD2L	O14523	706 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KRT76	Q01546	638 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	EDEM1	Q92611	657 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	IRF7	Q92985	503 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MARK1	Q9P0L2	795 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PHF24	Q9UPV7	400 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	WFS1	O76024	890 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KCNQ4	P56696	695 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	IDI1	Q13907	227 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62	5e-7	■■■■■ 26.9
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	POLI	Q9UNA4	740 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	NOS1	P29475	1434 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PLA2R1	Q13018	1463 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PDGFA	P04085	211 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	GMPR	P36959	345 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	LAMC2	Q13753	1193 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MX2	P20592	715 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955		E9PCH4	1651 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955		A6NHS1	94 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	EPB42	P16452	691 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SPEM2	Q0P670	501 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PTPRT	O14522	1441 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	XYLB	O75191	536 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	BMP4	P12644	408 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	SASH3	O75995	380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	C8orf34	Q49A92	452 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	PIK3C2B	O00750	1634 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ATP6AP2-231	ENST00000637955	CCIN	Q13939	588 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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