RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637848.1

EFR3A-208, Transcript of EFR3 homolog A, human

TSL 5 BASIC

Gene EFR3A, Length 2,547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFR3A-208	ENST00000637848	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	SPOCK2	Q92563	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	MYH3	P11055	1940 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	NBPF26	B4DH59	902 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	JAK2	O60674	1132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	PLCG2	P16885	1265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	FOSB	P53539	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	NBPF14	Q5TI25	921 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	NBPF15	Q8N660	670 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	RREB1	Q92766	1687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	NUP98	P52948	1817 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848		A0A087WZG4	1122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	MBD3	O95983	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	A1BG	P04217	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TIMM10	P62072	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF609	O15014	1411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TAF5L	O75529	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	LIG1	P18858	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CAMK4	Q16566	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	KCNB2	Q92953	911 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	SLIT2	O94813	1529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	BCL9	O00512	1426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	MED23	Q9ULK4	1368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CASP7	P55210	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848		A0A087WWV3	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CYP21A2	P08686	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	FOXO4	P98177	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	LAMB2	P55268	1798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	GOLIM4	O00461	696 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	OFD1	O75665	1012 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ADCY5	O95622	1261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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