RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 KLRK1P26718 216 aa36.55■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa36.55■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF408Q9H9D4 720 aa36.55■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PLIN1O60240 522 aa36.54■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 VEGFBP49765 207 aa36.54■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CELF2O95319 508 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CST9Q5W186 159 aa36.53■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 USP48Q86UV5 1035 aa36.53■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L8P0C7I0 530 aa36.52■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 RASSF10A6NK89 507 aa36.51■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SNAP23O00161 211 aa36.51■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 UTYO14607 1347 aa36.51■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT26Q7Z3Y9 468 aa36.5■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 KAZALD1Q96I82 304 aa36.5■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 MXD3Q9BW11 206 aa36.49■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 GRM1Q13255 1194 aa36.48■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 STRIP1Q5VSL9 837 aa36.48■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 GMLQ99445 158 aa36.48■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 DACT2Q5SW24 774 aa36.47■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 TTLL5Q6EMB2 1281 aa36.46■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 OGFOD1Q8N543 542 aa36.46■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 MYOZ2Q9NPC6 264 aa36.46■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 GGA3Q9NZ52 723 aa36.46■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 GTF2IP78347 998 aa36.45■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 USP44Q9H0E7 712 aa36.45■■■■□ 3.43
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF609O15014 1411 aa36.44■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 MYO3BQ8WXR4 1341 aa36.44■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 SCARF1Q14162 830 aa36.44■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 DLK2Q6UY11 383 aa36.44■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF804AQ7Z570 1209 aa36.44■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 SULF1Q8IWU6 871 aa36.44■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 CD209Q9NNX6 404 aa36.44■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 TLL2Q9Y6L7 1015 aa36.44■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 ADM5C9JUS6 153 aa36.43■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD44Q8N8A2 993 aa36.42■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 ECE1P42892 770 aa36.41■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 RARSP54136 660 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 CAPNS2Q96L46 248 aa36.41■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 TRPM7Q96QT4 1865 aa36.41■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 PCNTO95613 3336 aa36.41■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 CYP4F22Q6NT55 531 aa36.4■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 PSME4Q14997 1843 aa36.39■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 SAPCD2Q86UD0 394 aa36.39■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 AIDAQ96BJ3 306 aa36.39■■■■□ 3.42
SEMA3B-215ENST00000621029 KIAA0825Q8IV33 1275 aa36.38■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 IRS2Q9Y4H2 1338 aa36.37■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 MROH5Q6ZUA9 1318 aa36.36■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 HDAC9Q9UKV0 1011 aa36.36■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF16BQ96L93 1317 aa36.35■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 METTL24Q5JXM2 366 aa36.35■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa36.35■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 UBE4AQ14139 1066 aa36.34■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 KLHDC4Q8TBB5 520 aa36.34■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 IL1R1P14778 569 aa36.33■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 NBPF9Q3BBW0 867 aa36.33■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 LRRC24Q50LG9 513 aa36.33■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 C2orf69Q8N8R5 385 aa36.33■■■■□ 3.41
SEMA3B-215ENST00000621029 HUNKP57058 714 aa36.32■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 JAG2Q9Y219 1238 aa36.32■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 GYG1P46976 350 aa36.31■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 MMP14P50281 582 aa36.31■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 CDCA5Q96FF9 252 aa36.31■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 FOXN1O15353 648 aa36.3■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 SASH1O94885 1247 aa36.3■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 HHIPL1Q96JK4 782 aa36.29■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 WBP1LQ9NX94 342 aa36.29■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 HDAC5Q9UQL6 1122 aa36.29■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A1B0GUL6 1792 aa36.29■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa36.29■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 F8W031 263 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 WNT10BO00744 389 aa36.28■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 VPS37DQ86XT2 251 aa36.28■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 ARHGAP45Q92619 1136 aa36.28■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 AOC2O75106 756 aa36.27■■■■□ 3.4
SEMA3B-215ENST00000621029 IFFO2Q5TF58 517 aa36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms