RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620505.1

TARDBP-222, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-222	ENST00000620505	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	GREM2	Q9H772	168 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	XDH	P47989	1333 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SCARF1	Q14162	830 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	RGMB	Q6NW40	437 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	NOG	Q13253	232 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	DGKZ	Q13574	1117 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	CA12	O43570	354 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	KLRK1	P26718	216 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	GML	Q99445	158 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TARDBP-222	ENST00000620505	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505		H7C1W4	665 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	TRPA1	O75762	1119 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	FLII	Q13045	1269 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	GCKR	Q14397	625 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	SASH1	O94885	1247 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC10A3	P09131	477 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	ITGA6	P23229	1130 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	RNF186	Q9NXI6	227 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505		F6X3S4	739 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	SNAP23	O00161	211 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	KCNJ4	P48050	445 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	CLCN6	P51797	869 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	CASP7	P55210	303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	PRKG1	Q13976	671 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	IL16	Q14005	1332 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	PSME4	Q14997	1843 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	VAMP4	O75379	141 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	TAF5L	O75529	589 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	GTF2I	P78347	998 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF609	O15014	1411 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	MYH3	P11055	1940 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	WNT10B	O00744	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	CSF1R	P07333	972 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TARDBP-222	ENST00000620505	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62

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