RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.15□□□□□ -0.14
CCL3L3-201ENST00000612839 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
CCL3L3-201ENST00000612839 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
CCL3L3-201ENST00000612839 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.15□□□□□ -0.14
CCL3L3-201ENST00000612839 COG6Q9Y2V7 657 aa14.15□□□□□ -0.14
CCL3L3-201ENST00000612839 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.15□□□□□ -0.14
CCL3L3-201ENST00000612839 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.15□□□□□ -0.14
CCL3L3-201ENST00000612839 WDR90Q96KV7 1748 aa14.15□□□□□ -0.14
CCL3L3-201ENST00000612839 SNAP23O00161 211 aa14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 PDE3AQ14432 1141 aa14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 LRRC24Q50LG9 513 aa14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 MED23Q9ULK4 1368 aa14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 SCN9AQ15858 1988 aa14.14□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 YDJCA8MPS7 323 aa14.13□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 SRGAP3O43295 1099 aa14.13□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 KLRK1P26718 216 aa14.13□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.13□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.13□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 DOK7Q18PE1 504 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 GPC2Q8N158 579 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 POTECB2RU33 542 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 EYA2O00167 538 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 KIF3CO14782 793 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 ECE2O60344 883 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 CXCL9Q07325 125 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 RRAGCQ9HB90 399 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 COPRSQ9NQ92 184 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.12□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 PSME4Q14997 1843 aa14.11□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 SCN4AP35499 1836 aa14.11□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNJ4P48050 445 aa14.11□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 RRP1P56182 461 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 SIL1Q9H173 461 aa14.11□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.11□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXO3Q9UK99 471 aa14.11□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 RAD17O75943 681 aa14.1□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 CIAO1O76071 339 aa14.1□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 PDE8BO95263 885 aa14.1□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 METTL24Q5JXM2 366 aa14.1□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.1□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.1□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 G3V3G9 751 aa14.09□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 ATP8B2P98198 1209 aa14.09□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE4AQ14139 1066 aa14.09□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.09□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.09□□□□□ -0.15
CCL3L3-201ENST00000612839 SCNN1DP51172 638 aa14.08□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 CEP85Q6P2H3 762 aa14.08□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 PODNQ7Z5L7 613 aa14.08□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 SSH3Q8TE77 659 aa14.08□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 COA1Q9GZY4 146 aa14.08□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 PSMD14O00487 310 aa14.07□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 TNIP1Q15025 636 aa14.07□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 FGFR2P21802 821 aa14.06□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 CD209Q9NNX6 404 aa14.06□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.06□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 GYG1P46976 350 aa14.05□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.05□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.05□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.05□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 HACL1Q9UJ83 578 aa14.05□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L3A6NCW0 530 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L4A6NCW7 530 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 TOMM70O94826 608 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 IL1R1P14778 569 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 EPHX2P34913 555 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 EPS15P42566 896 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 LPIN2Q92539 896 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF609O15014 1411 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.04□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.03□□□□□ -0.16
CCL3L3-201ENST00000612839 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms