RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 PODNQ7Z5L7 613 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 OGFOD1Q8N543 542 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.62■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 INHBEP58166 350 aa24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L3A6NCW0 530 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L4A6NCW7 530 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.6■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 GOLGA2Q08379 1002 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 MOB2Q70IA6 237 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 GMLQ99445 158 aa24.59■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.58■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.58■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 STK31Q9BXU1 1019 aa24.58■■□□□ 1.53
SGMS1-208ENST00000608287 XDHP47989 1333 aa24.58■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM17Q9Y577 477 aa24.57■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 ATP2B4P23634 1241 aa24.56■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF428Q96B54 188 aa24.56■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.56■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.55■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 ERO1AQ96HE7 468 aa24.55■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF521Q96K83 1311 aa24.53■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.52■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 SPRYD7Q5W111 196 aa24.52■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.52■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.52■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.52■■□□□ 1.52
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 COL4A1P02462 1669 aa24.51■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 WNT10BO00744 389 aa24.51■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 SLC4A2P04920 1241 aa24.51■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 MYD88Q99836 296 aa24.51■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 MED23Q9ULK4 1368 aa24.51■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 UNCXA6NJT0 531 aa24.5■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 VAMP4O75379 141 aa24.5■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.5■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.5■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 POTEFA5A3E0 1075 aa24.49■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 PDE8AO60658 829 aa24.49■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.49■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 IFNL1Q8IU54 200 aa24.49■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.49■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF6Q15052 776 aa24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 G2E3Q7L622 706 aa24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 MIER1Q8N108 512 aa24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 ARMC5Q96C12 935 aa24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.48■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 LAMB1P07942 1786 aa24.47■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.47■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 KSR2Q6VAB6 950 aa24.47■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.47■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 DACT2Q5SW24 774 aa24.46■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.46■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 COA1Q9GZY4 146 aa24.46■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.46■■□□□ 1.51
SGMS1-208ENST00000608287 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 FBXW7Q969H0 707 aa24.45■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 EFCC1Q9HA90 598 aa24.45■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.45■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 CACNA1FO60840 1977 aa24.44■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 FLIIQ13045 1269 aa24.44■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 PRKG1Q13976 671 aa24.44■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K11Q16584 847 aa24.44■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 NBPF11Q86T75 865 aa24.44■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 E9PSI1 815 aa24.43■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 SASH1O94885 1247 aa24.42■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.42■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 WNK4Q96J92 1243 aa24.41■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 SP3Q02447 781 aa24.4■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 SLFN5Q08AF3 891 aa24.4■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.4■■□□□ 1.5
SGMS1-208ENST00000608287 MYO1BO43795 1136 aa24.39■■□□□ 1.49
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