RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598968.5

TIMM44-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, human

TSL 3

Gene TIMM44, Length 797 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM44-208	ENST00000598968	LDHD	Q86WU2	507 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	GNAI2	P04899	355 aa		28.23	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	SCN9A	Q15858	1988 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	USP17L3	A6NCW0	530 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	USP17L4	A6NCW7	530 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	MS4A1	P11836	297 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	HSPA6	P17066	643 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	FBXW7	Q969H0	707 aa		28.22	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968		H7C1D1	291 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	UBE4A	Q14139	1066 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	DPF2	Q92785	391 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
TIMM44-208	ENST00000598968	EYA2	O00167	538 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	MICALL2	Q8IY33	904 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	PANK1	Q8TE04	598 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	SIL1	Q9H173	461 aa		28.2	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	SRGAP3	O43295	1099 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	CD209	Q9NNX6	404 aa		28.19	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	SHTN1	A0MZ66	631 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	PDE8B	O95263	885 aa		28.17	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	PSME4	Q14997	1843 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	FBXO3	Q9UK99	471 aa		28.16	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	CIAO1	O76071	339 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	MTX1	Q13505	466 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		28.15	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	GYG1	P46976	350 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	GTF2I	P78347	998 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	COPRS	Q9NQ92	184 aa		28.14	■■■□□ 2.1
TIMM44-208	ENST00000598968	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		28.14	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	APLP1	P51693	650 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	DACT2	Q5SW24	774 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	MXD3	Q9BW11	206 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		28.13	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	IL1R1	P14778	569 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	28.12	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	VPS37D	Q86XT2	251 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	CNTROB	Q8N137	903 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	28.11	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	USP17L8	P0C7I0	530 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	GML	Q99445	158 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	SLC5A1	P13866	664 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF609	O15014	1411 aa		28.09	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	ATP8B2	P98198	1209 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		28.08	■■■□□ 2.09
TIMM44-208	ENST00000598968	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	EGFR	P00533	1210 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	FGFR2	P21802	821 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	OGFOD1	Q8N543	542 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	LPIN2	Q92539	896 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	JAG2	Q9Y219	1238 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	SASH1	O94885	1247 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.05	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	PASK	Q96RG2	1323 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	BCAM	P50895	628 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	HTRA3	P83110	453 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	PDE3A	Q14432	1141 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TIMM44-208	ENST00000598968	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08

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