RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597304.5

ZNF558-205, Transcript of zinc finger protein 558, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF558, Length 2,612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558-205ENST00000597304 APOBRQ0VD83 1088 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 C14orf37Q86TY3 774 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 CCP110O43303 1012 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 CYP2C19P33261 490 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 ADALQ6DHV7 355 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 HOMER1Q86YM7 354 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 IP6K1Q92551 441 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF558-205ENST00000597304 A0A1B0GVL5 298 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 GUCY1B3Q02153 619 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 A0A1W2PQ27 194 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 A0A1W2PQ64 194 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 A0A1W2PQD8 194 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NDUFA8P51970 172 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 TNNI3KQ59H18 835 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 CHGBP05060 677 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 IGKV5-2P06315 115 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 GORABQ5T7V8 394 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 UBXN4Q92575 508 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 DNAI1Q9UI46 699 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 EID1Q9Y6B2 187 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 PLA2G4AP47712 749 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 STK38Q15208 465 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 MNS1Q8NEH6 495 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 PPFIA3O75145 1194 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NLRP12P59046 1061 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 TFCP2Q12800 502 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 TEX35Q5T0J7 233 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 HAUS7Q99871 368 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 COPRSQ9NQ92 184 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 PXDNQ92626 1479 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 BIN1O00499 593 aa14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NEDD4P46934 1319 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 TULP2O00295 520 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 FANCCQ00597 558 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 GCKRQ14397 625 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NCAPHQ15003 741 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 TBX22Q9Y458 520 aa14.6□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 NFAT5O94916 1531 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 YEATS4O95619 227 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 TPM1P09493 284 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.59□□□□□ -0.07
ZNF558-205ENST00000597304 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.4 ms