RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595081.5

PNKP-205, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 2

Gene PNKP, Length 513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-205	ENST00000595081	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PNKP-205	ENST00000595081	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PNKP-205	ENST00000595081	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PNKP-205	ENST00000595081	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	28.39	■■■□□ 2.14
PNKP-205	ENST00000595081	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PNKP-205	ENST00000595081	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PNKP-205	ENST00000595081	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	FGFR2	P21802	821 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	TFCP2	Q12800	502 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	GPC2	Q8N158	579 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	COA1	Q9GZY4	146 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	GYG1	P46976	350 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	SCN9A	Q15858	1988 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	ATP2B3	Q16720	1220 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	PODN	Q7Z5L7	613 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	PSMD14	O00487	310 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	HMMR	O75330	724 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	SASH1	O94885	1247 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	LPIN2	Q92539	896 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	RRAGC	Q9HB90	399 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	CD209	Q9NNX6	404 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	SLC5A1	P13866	664 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	TNIP1	Q15025	636 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PNKP-205	ENST00000595081	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	WDR90	Q96KV7	1748 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	POTEC	B2RU33	542 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	FBXW7	Q969H0	707 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	USP17L3	A6NCW0	530 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	USP17L4	A6NCW7	530 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	IL1R1	P14778	569 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	ADORA1	P30542	326 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	BCAM	P50895	628 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	TIMM10	P62072	90 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	VPS37D	Q86XT2	251 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081		A0A1B0GUL7	405 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	SCNN1D	P51172	638 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	GTF2I	P78347	998 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	MXD3	Q9BW11	206 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	JAG2	Q9Y219	1238 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	ZNF609	O15014	1411 aa		28.26	■■■□□ 2.12
PNKP-205	ENST00000595081	APBB1	O00213	710 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	KIF3C	O14782	793 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	28.26	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	DACT2	Q5SW24	774 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	HACL1	Q9UJ83	578 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	PSME4	Q14997	1843 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	TNNI3K	Q59H18	835 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	SHTN1	A0MZ66	631 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	EPS15	P42566	896 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	PHKA1	P46020	1223 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	GPR108	Q9NPR9	543 aa		28.22	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	28.21	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	28.21	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	AAMP	Q13685	434 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	SCN4A	P35499	1836 aa		28.2	■■■□□ 2.11
PNKP-205	ENST00000595081	EPHX2	P34913	555 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PNKP-205	ENST00000595081	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	28.2	■■■□□ 2.1
PNKP-205	ENST00000595081	CCDC102B	Q68D86	513 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PNKP-205	ENST00000595081	MICALL2	Q8IY33	904 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PNKP-205	ENST00000595081	DPF2	Q92785	391 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PNKP-205	ENST00000595081	GML	Q99445	158 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PNKP-205	ENST00000595081	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1

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