RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 MINPP1Q9UNW1 487 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 NEXNQ0ZGT2 675 aa13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 STK31Q9BXU1 1019 aa13.24□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 NEURL1BA8MQ27 555 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 DACT2Q5SW24 774 aa13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 H7C1W4 665 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC34A2O95436 690 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 NBPF9Q3BBW0 867 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 G2E3Q7L622 706 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 MXD3Q9BW11 206 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 COA1Q9GZY4 146 aa13.22□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 WNT10BO00744 389 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC27Q2M243 656 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 MOB2Q70IA6 237 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 TXNRD3Q86VQ6 643 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 OGFOD1Q8N543 542 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 LEMD3Q9Y2U8 911 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 CACNA1FO60840 1977 aa13.21□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC4A2P04920 1241 aa13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 GCKRQ14397 625 aa13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 WWC1Q8IX03 1113 aa13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXW7Q969H0 707 aa13.2□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF804BA4D1E1 1349 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 ITGA6P23229 1130 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 KLRK1P26718 216 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 MMP14P50281 582 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 CASP7P55210 303 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC184Q52MB2 194 aa13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 IL16Q14005 1332 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 SASH1O94885 1247 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 CSF1RP07333 972 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 NF2P35240 595 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 FLIIQ13045 1269 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 MPHOSPH8Q99549 860 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD2Q9GZV1 360 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.18□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GUL6 1792 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.17□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 TM4SF4P48230 202 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 SOX10P56693 466 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 GTF2IP78347 998 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 CHRNDQ07001 517 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 LINS1Q8NG48 757 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 ECM29Q5VYK3 1845 aa13.16□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D8O95759 1140 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNJ4P48050 445 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 CD209Q9NNX6 404 aa13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 IRS2Q9Y4H2 1338 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.14□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 GPR25O00155 361 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 SNAP23O00161 211 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 VAMP4O75379 141 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXO4P98177 505 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 SREBF2Q12772 1141 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKG1Q13976 671 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 CERS5Q8N5B7 392 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.13□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 LAMB1P07942 1786 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 TAF5LO75529 589 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 DLGAP5Q15398 846 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRYD7Q5W111 196 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 MTMR14Q8NCE2 650 aa13.12□□□□□ -0.31
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms