RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592940.2

GPX4-208, Transcript of glutathione peroxidase 4, human

TSL 5

Gene GPX4, Length 1,184 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPX4-208	ENST00000592940	ZNF609	O15014	1411 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	CHADL	Q6NUI6	762 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	PODN	Q7Z5L7	613 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	COA1	Q9GZY4	146 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		28.05	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	PANK1	Q8TE04	598 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	METTL24	Q5JXM2	366 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	MICALL2	Q8IY33	904 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	EYA2	O00167	538 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	DPF2	Q92785	391 aa		28.02	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
GPX4-208	ENST00000592940	USP17L3	A6NCW0	530 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	USP17L4	A6NCW7	530 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	GNAI2	P04899	355 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	MTX1	Q13505	466 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	UBE4A	Q14139	1066 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	SIL1	Q9H173	461 aa		28.01	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	MXD3	Q9BW11	206 aa		28	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	CD209	Q9NNX6	404 aa		28	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		28	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	GML	Q99445	158 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	PDE8B	O95263	885 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	EGFR	P00533	1210 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	CIAO1	O76071	339 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	GYG1	P46976	350 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GPX4-208	ENST00000592940		H7C1D1	291 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	IL1R1	P14778	569 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	FGFR2	P21802	821 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	GTF2I	P78347	998 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	APLP1	P51693	650 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	HTRA3	P83110	453 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	MS4A1	P11836	297 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	CEP350	Q5VT06	3117 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	COG6	Q9Y2V7	657 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.9	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.89	■■■□□ 2.06
GPX4-208	ENST00000592940	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	POLA2	Q14181	598 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	SLC5A1	P13866	664 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	BCAM	P50895	628 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	LPIN2	Q92539	896 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
GPX4-208	ENST00000592940	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.87	■■■□□ 2.05

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