RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
APBA3-208	ENST00000592826	EYA2	O00167	538 aa		28.01	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	CIAO1	O76071	339 aa		28.01	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	POTEI	P0CG38	1075 aa		28.01	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	POTEJ	P0CG39	1038 aa		28.01	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	PLIN1	O60240	522 aa		28	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	METTL24	Q5JXM2	366 aa		28	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	COPRS	Q9NQ92	184 aa		28	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.99	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	EPHX2	P34913	555 aa		27.99	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.99	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.99	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	PANK1	Q8TE04	598 aa		27.99	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	DPF2	Q92785	391 aa		27.99	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	PSMD14	O00487	310 aa		27.98	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	PDE8B	O95263	885 aa		27.98	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	SCNN1D	P51172	638 aa		27.98	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.98	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.98	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		27.98	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.97	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		27.97	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.96	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.96	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.96	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.96	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.95	■■■□□ 2.07
APBA3-208	ENST00000592826	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.95	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.94	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.94	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.94	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.94	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.94	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF609	O15014	1411 aa		27.93	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826		H7C1D1	291 aa		27.93	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	KLRK1	P26718	216 aa		27.93	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.93	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.93	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.93	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	CNTNAP1	P78357	1384 aa		27.92	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	SNAP23	O00161	211 aa		27.92	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	IL1R1	P14778	569 aa		27.92	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	EPS15	P42566	896 aa		27.92	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	MMP14	P50281	582 aa		27.92	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.92	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	CAPN15	O75808	1086 aa		27.91	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.91	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	SIL1	Q9H173	461 aa		27.91	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.91	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		27.9	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.9	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	LPIN2	Q92539	896 aa		27.9	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	COG6	Q9Y2V7	657 aa		27.9	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	FGFR2	P21802	821 aa		27.89	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	SSH3	Q8TE77	659 aa		27.89	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
APBA3-208	ENST00000592826	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.88	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.88	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	SLC5A1	P13866	664 aa		27.88	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	POLA2	Q14181	598 aa		27.88	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.88	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.88	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.88	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	PSME4	Q14997	1843 aa		27.88	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	SASH1	O94885	1247 aa		27.87	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.87	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.87	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.86	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	GML	Q99445	158 aa		27.86	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		27.86	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.86	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	GTF2I	P78347	998 aa		27.85	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.85	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.84	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	GYG1	P46976	350 aa		27.84	■■■□□ 2.05
APBA3-208	ENST00000592826	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05

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