RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 SUCLG2Q96I99 432 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR14Q9BWN1 585 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 S1PR4O95977 384 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC173Q0VFZ6 552 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF20Q5VTR2 975 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 MYD88Q99836 296 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 TM6SF1Q9BZW5 370 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 MYL6BP14649 208 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMA5P28066 241 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 GGCXP38435 758 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 TICAM2Q86XR7 235 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 PAPPAQ13219 1627 aa11.02□□□□□ -0.64
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV5-2P06315 115 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNJ4P48050 445 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC39A6Q13433 755 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 HIC1Q14526 733 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS53Q5VIR6 699 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 COPS6Q7L5N1 327 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 FSD1Q9BTV5 496 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 COPRSQ9NQ92 184 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SNRKQ9NRH2 765 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 GLI3P10071 1580 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 UBR2Q8IWV8 1755 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 TOM1O60784 492 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PKP1Q13835 747 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD1Q15327 319 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNB2Q92953 911 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC14Q96N46 770 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PRDM11Q9NQV5 511 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.01□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP27B1O15528 508 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 OATP04181 439 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CASTP20810 708 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC19A1P41440 591 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 AK2P54819 239 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT32Q14532 448 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PHOX2BQ99453 314 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PANK2Q9BZ23 570 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ZMYND15Q9H091 742 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PDRG1Q9NUG6 133 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCA3Q99758 1704 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 MED23Q9ULK4 1368 aa11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 SASH1O94885 1247 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRNA2Q15822 529 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G2CQ5R387 149 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 BARGINQ6ZT62 677 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 KAZALD1Q96I82 304 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 IL25Q9H293 177 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 JCADQ9P266 1359 aa10.99□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 NUP188Q5SRE5 1749 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP5JP18859 108 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 PDCP20941 246 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 TNNI3KQ59H18 835 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa10.98□□□□□ -0.65
EFTUD2-222ENST00000592408 BRINP3Q76B58 766 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms