RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589742.5

RFX2-215, Transcript of regulatory factor X2, human

TSL 4

Gene RFX2, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RFX2-215	ENST00000589742	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	14.81	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	UBE4A	Q14139	1066 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	FBXO3	Q9UK99	471 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	PSMD14	O00487	310 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	GYG1	P46976	350 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	COA1	Q9GZY4	146 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	FGFR2	P21802	821 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	TFCP2	Q12800	502 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	GPC2	Q8N158	579 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	FBXW7	Q969H0	707 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	CD209	Q9NNX6	404 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742		A0A1B0GUL6	1792 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	KIF3C	O14782	793 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	TNIP1	Q15025	636 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	PODN	Q7Z5L7	613 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	SCN9A	Q15858	1988 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RFX2-215	ENST00000589742	SASH1	O94885	1247 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	SLC5A1	P13866	664 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	BCAM	P50895	628 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	TIMM10	P62072	90 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	ATP2B3	Q16720	1220 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	LPIN2	Q92539	896 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	MXD3	Q9BW11	206 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	SHTN1	A0MZ66	631 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	USP17L3	A6NCW0	530 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	USP17L4	A6NCW7	530 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	EPS15	P42566	896 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	SCNN1D	P51172	638 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	GTF2I	P78347	998 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	JAG2	Q9Y219	1238 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	HMMR	O75330	724 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	ADORA1	P30542	326 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	VPS37D	Q86XT2	251 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	HACL1	Q9UJ83	578 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742		A0A1B0GUL7	405 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	APBB1	O00213	710 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	IL1R1	P14778	569 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	WDR90	Q96KV7	1748 aa		14.74	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	POTEI	P0CG38	1075 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	POTEJ	P0CG39	1038 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	EPHX2	P34913	555 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	DACT2	Q5SW24	774 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	XAGE2	Q96GT9	111 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	BCL11A	Q9H165	835 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	PHKA1	P46020	1223 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	MICALL2	Q8IY33	904 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	DPF2	Q92785	391 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742		H7C1D1	291 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	TNNI3K	Q59H18	835 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	GML	Q99445	158 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RFX2-215	ENST00000589742	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
RFX2-215	ENST00000589742	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RFX2-215	ENST00000589742	CCDC102B	Q68D86	513 aa		14.7	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms