RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	NUDT8	Q8WV74	236 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	ACD	Q96AP0	544 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	OSMR	Q99650	979 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	UNCX	A6NJT0	531 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAP3K10	Q02779	954 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEP135	Q66GS9	1140 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	ELOA3	Q8NG57	546 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	TNFRSF25	Q93038	417 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A1W2PP55	124 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM177B	A6PVY3	158 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIF4A	O95239	1232 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	GNA15	P30679	374 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	PERM1	Q5SV97	790 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	CEP120	Q8N960	986 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	PLD4	Q96BZ4	506 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	HHIP	Q96QV1	700 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	BCO2	Q9BYV7	579 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	RRAGC	Q9HB90	399 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	NAGPA	Q9UK23	515 aa		5.09	□□□□□ -1.59
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494		E9PSI1	815 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	SORBS3	O60504	671 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	BCR	P11274	1271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPX	P11678	715 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	BAG6	P46379	1132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	DAB2	P98082	770 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRM2	Q14416	872 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	PBX4	Q9BYU1	374 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	METTL12	A8MUP2	240 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	OIP5	O43482	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	FURIN	P09958	794 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	CDC25B	P30305	580 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	FCGRT	P55899	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHSY3	Q70JA7	882 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMC4	Q7Z404	712 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	FRMD6	Q96NE9	622 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	C12orf49	Q9H741	205 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494		M0R082	166 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALB	P02768	609 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP17L7	P0C7H9	530 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	ITGAE	P38570	1179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	BTBD6	Q96KE9	485 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	AK5	Q9Y6K8	562 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	GIPC1	O14908	333 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	LILRB5	O75023	590 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	PTPRA	P18433	802 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRIA4	P48058	902 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	NXPE3	Q969Y0	559 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	TCF12	Q99081	682 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6

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