RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586875.1

EFTUD2-207, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-207ENST00000586875 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 HIF1AQ16665 826 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SYT9Q86SS6 491 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 CEP63Q96MT8 703 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 HINFPQ9BQA5 517 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.27□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L15C9J2P7 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L10C9JJH3 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L12C9JPN9 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L11C9JVI0 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L21D6R901 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L18D6R9N7 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L22D6RA61 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L19D6RCP7 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L20D6RJB6 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ALAS2P22557 587 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 COL8A1P27658 744 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 USP17L24Q0WX57 530 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 NEUROD1Q13562 356 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 GRIN2CQ14957 1233 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SUSD3Q96L08 255 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 BRD7Q9NPI1 651 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SIN3BO75182 1162 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ITGB2P05107 769 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 DPYDQ12882 1025 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ELOA3Q8NG57 546 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 NGLY1Q96IV0 654 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SHPRHQ149N8 1683 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 KRBA1A5PL33 1030 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 KCNQ4P56696 695 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 TYRO3Q06418 890 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SPEM2Q0P670 501 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SLC30A3Q99726 388 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 TET3O43151 1660 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ARHGEF5Q12774 1597 aa7.24□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ATF3P18847 181 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 IGFBP4P22692 258 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 C8orf37Q96NL8 207 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.23□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 DIP2AQ14689 1571 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 DCCP43146 1447 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 PROCP04070 461 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 RTN1Q16799 776 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 BRINP3Q76B58 766 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 TNFRSF25Q93038 417 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 MDFIQ99750 246 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 PIK3C2BO00750 1634 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ADGRB3O60242 1522 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.22□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 KANK1Q14678 1352 aa7.21□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.21□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 ERBINQ96RT1 1412 aa7.21□□□□□ -1.25
EFTUD2-207ENST00000586875 IGSF3O75054 1194 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.21□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 MAST1Q9Y2H9 1570 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 LGR5O75473 907 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 IER5Q5VY09 327 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 RGS22Q8NE09 1264 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 KIF15Q9NS87 1388 aa7.2□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 IDI1Q13907 227 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 TRIM11Q96F44 468 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 PLVAPQ9BX97 442 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 EFCC1Q9HA90 598 aa7.19□□□□□ -1.26
EFTUD2-207ENST00000586875 PIK3R4Q99570 1358 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms