RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585934.1

TRAPPC6A-202, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-202ENST00000585934 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.57■□□□□ 0.88
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 TAF5LO75529 589 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KAZALD1Q96I82 304 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6A-202ENST00000585934 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC6A-202ENST00000585934 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.46■□□□□ 0.87
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.46■□□□□ 0.87
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-202ENST00000585934 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-202ENST00000585934 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-202ENST00000585934 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC6A-202ENST00000585934 VPS37DQ86XT2 251 aa20.42■□□□□ 0.86
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TRAPPC6A-202ENST00000585934 PDE8BO95263 885 aa20.41■□□□□ 0.86
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