RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583763.1

CSAG4-202, Transcript of CSAG family member 4 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene CSAG4, Length 237 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG4-202ENST00000583763 NF2P35240 595 aa12.98□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 DCTN1Q14203 1278 aa12.98□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 CTGFP29279 349 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 PLA2G5P39877 138 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 BCAMP50895 628 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 NLRP10Q86W26 655 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 MS4A4AQ96JQ5 239 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 GUCD1Q96NT3 240 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 EYA3Q99504 573 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 POLR3GLQ9BT43 218 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 MXD3Q9BW11 206 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 CDH23Q9H251 3354 aa12.97□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 GJB1P08034 283 aa12.96□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 PDIA6Q15084 440 aa12.96□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.96□□□□□ -0.33
CSAG4-202ENST00000583763 RPTORQ8N122 1335 aa12.95□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 POTEB2H3BUK9 544 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 SASH1O94885 1247 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 NKX2-3Q8TAU0 364 aa12.94□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 USP17L3A6NCW0 530 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 USP17L4A6NCW7 530 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 EVI5O60447 810 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 ARHGEF6Q15052 776 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 USP17L1Q7RTZ2 530 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 BRI3BPQ8WY22 251 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.93□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 UNCXA6NJT0 531 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 USP2O75604 605 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 CCL5P13501 91 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 PRKAR2BP31323 418 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 DACT2Q5SW24 774 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 FAM43AQ8N2R8 423 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 ZNF428Q96B54 188 aa12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 PROSER3Q2NL68 480 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 DEFB129Q9H1M3 183 aa12.91□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 UFL1O94874 794 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 RPS8P62241 208 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 PODNQ7Z5L7 613 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 TDHQ8IZJ6 230 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa12.9□□□□□ -0.34
CSAG4-202ENST00000583763 OTOFQ9HC10 1997 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 SGPL1O95470 568 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 PRMT2P55345 433 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 RNF208Q9H0X6 261 aa12.89□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 TLR2O60603 784 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 GNRH1P01148 92 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 ANXA1P04083 346 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 GRK4P32298 578 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 OPTNQ96CV9 577 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 FAM122AQ96E09 287 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 SEC31BQ9NQW1 1179 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 SRRDQ9UH36 339 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 KNSTRNQ9Y448 316 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 G3V3G9 751 aa12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 TRIM47Q96LD4 638 aa12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 UNC93B1Q9H1C4 597 aa12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 GGA1Q9UJY5 639 aa12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 AOX1Q06278 1338 aa12.87□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 OSBPP22059 807 aa12.86□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 C17orf99Q6UX52 265 aa12.86□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa12.86□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 OGFOD1Q8N543 542 aa12.86□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 FAM89AQ96GI7 184 aa12.86□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 CCL15Q16663 113 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 COPS6Q7L5N1 327 aa12.85□□□□□ -0.35
CSAG4-202ENST00000583763 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms