RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580691.5

CYB561-211, Transcript of cytochrome b561, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYB561, Length 1,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561-211ENST00000580691 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.66■■■□□ 2.18
CYB561-211ENST00000580691 CNTROBQ8N137 903 aa28.66■■■□□ 2.18
CYB561-211ENST00000580691 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CYB561-211ENST00000580691 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.66■■■□□ 2.18
CYB561-211ENST00000580691 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CYB561-211ENST00000580691 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CYB561-211ENST00000580691 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.64■■■□□ 2.18
CYB561-211ENST00000580691 MS4A1P11836 297 aa28.63■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.63■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 PASKQ96RG2 1323 aa28.63■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 PLIN1O60240 522 aa28.62■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 METTL24Q5JXM2 366 aa28.62■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 MEIS3Q99687 375 aa28.62■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 CD209Q9NNX6 404 aa28.62■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.61■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 CREBZFQ9NS37 354 aa28.61■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 USP17L8P0C7I0 530 aa28.6■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.6■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 OGFOD1Q8N543 542 aa28.6■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.6■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 EYA2O00167 538 aa28.59■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 GNAI2P04899 355 aa28.59■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 IL1R1P14778 569 aa28.59■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 DACT2Q5SW24 774 aa28.59■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 GMLQ99445 158 aa28.59■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.59■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 PSME4Q14997 1843 aa28.59■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 SCN9AQ15858 1988 aa28.59■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 CIAO1O76071 339 aa28.58■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 PDE8BO95263 885 aa28.58■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 KLRK1P26718 216 aa28.58■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CYB561-211ENST00000580691 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 MTX1Q13505 466 aa28.57■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 LRRC24Q50LG9 513 aa28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 TRPM4Q8TD43 1214 aa28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 FBXW7Q969H0 707 aa28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 HDAC9Q9UKV0 1011 aa28.56■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.55■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 VPS37DQ86XT2 251 aa28.55■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 COPRSQ9NQ92 184 aa28.55■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 A0A1B0GUL6 1792 aa28.55■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 SNAP23O00161 211 aa28.54■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 GTF2IP78347 998 aa28.54■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.54■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.54■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 SASH1O94885 1247 aa28.53■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.53■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 KLRG1Q96E93 195 aa28.53■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 SRGAP3O43295 1099 aa28.52■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.52■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.52■■■□□ 2.16
CYB561-211ENST00000580691 SHTN1A0MZ66 631 aa28.51■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 LPIN2Q92539 896 aa28.51■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 SLC5A1P13866 664 aa28.5■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.5■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.5■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.49■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.49■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.49■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 TNNQ9UQP3 1299 aa28.49■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.48■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 SULF1Q8IWU6 871 aa28.48■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 SIL1Q9H173 461 aa28.48■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 FGFR2P21802 821 aa28.47■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 GYG1P46976 350 aa28.47■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 HTRA3P83110 453 aa28.47■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.47■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.46■■■□□ 2.15
CYB561-211ENST00000580691 EGFRP00533 1210 aa28.45■■■□□ 2.14
CYB561-211ENST00000580691 SCARF1Q14162 830 aa28.45■■■□□ 2.14
CYB561-211ENST00000580691 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.45■■■□□ 2.14
CYB561-211ENST00000580691 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
CYB561-211ENST00000580691 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms