RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569224.1

DDX19B-215, Transcript of DEAD-box helicase 19B, human

TSL 2

Gene DDX19B, Length 707 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX19B-215	ENST00000569224	SCN4A	P35499	1836 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	FGFR2	P21802	821 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	KCNJ4	P48050	445 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF609	O15014	1411 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	CXCL9	Q07325	125 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	GPC2	Q8N158	579 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	CRBN	Q96SW2	442 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	POTEC	B2RU33	542 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.56	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	RAD17	O75943	681 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	SASH1	O94885	1247 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	IL1R1	P14778	569 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	PSMD14	O00487	310 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	KIF3C	O14782	793 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	SCNN1D	P51172	638 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	TFCP2	Q12800	502 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	ATP2B3	Q16720	1220 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	LPIN2	Q92539	896 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.54	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224		G3V3G9	751 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	HMMR	O75330	724 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	SLC5A1	P13866	664 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	GYG1	P46976	350 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	TNIP1	Q15025	636 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	RRAGC	Q9HB90	399 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.56
DDX19B-215	ENST00000569224		A0A1B0GUL7	405 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	AAMP	Q13685	434 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	ADORA1	P30542	326 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	BCAM	P50895	628 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	GML	Q99445	158 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	EPS15	P42566	896 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	TIMM10	P62072	90 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	GTF2I	P78347	998 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	DPF2	Q92785	391 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.5	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.49	□□□□□ -0.57
DDX19B-215	ENST00000569224	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57

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