RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PI16Q6UXB8 463 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZMYND15Q9H091 742 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CTDNEP1O95476 244 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCARF1Q14162 830 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIGBQ92521 554 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATG3Q9NT62 314 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UQCRHP07919 91 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZAP70P43403 619 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFAP45Q9UL16 551 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 METTL24Q5JXM2 366 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STARD3NLO95772 234 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HLFQ16534 295 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIF3AQ9Y496 699 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A0G2JS52 829 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CBX8Q9HC52 389 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FGAP02671 866 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ITGA6P23229 1130 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP2B3Q16720 1220 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DRC7Q8IY82 874 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GREM2Q9H772 168 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BTG4Q9NY30 223 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP28Q96RU2 1077 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TJP1Q07157 1748 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ME1P48163 572 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF165P49910 485 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNS2Q63HR2 1409 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FOXP2O15409 715 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRC1O43663 620 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TERF1P54274 439 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRIM5Q9C035 493 aa14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GPAA1O43292 621 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CSF1RP07333 972 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 APPBP2Q92624 585 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 APPP05067 770 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MCAMP43121 646 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NLRP10Q86W26 655 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLHL34Q8N239 644 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.54□□□□□ -0.08
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FBXW7Q969H0 707 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms