RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567264.1

UBFD1-208, Transcript of ubiquitin family domain containing 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene UBFD1, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBFD1-208	ENST00000567264	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		27.96	■■■□□ 2.07
UBFD1-208	ENST00000567264	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		27.96	■■■□□ 2.07
UBFD1-208	ENST00000567264	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
UBFD1-208	ENST00000567264	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		27.96	■■■□□ 2.07
UBFD1-208	ENST00000567264	ZNF609	O15014	1411 aa		27.95	■■■□□ 2.07
UBFD1-208	ENST00000567264		A0A1B0GUL7	405 aa		27.95	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	SMC5	Q8IY18	1101 aa		27.95	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		27.95	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.95	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264		G3V3G9	751 aa		27.94	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.94	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	BCL11A	Q9H165	835 aa		27.94	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		27.94	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	KLRK1	P26718	216 aa		27.93	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	TIMM10	P62072	90 aa		27.93	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.92	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		27.92	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.91	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	AACS	Q86V21	672 aa		27.91	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		27.91	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	NIM1K	Q8IY84	436 aa		27.91	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	JDP2	Q8WYK2	163 aa		27.91	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.91	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	PRELP	P51888	382 aa		27.9	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.9	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		27.9	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.9	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.9	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	RNF181	Q9P0P0	153 aa		27.9	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	ADORA1	P30542	326 aa		27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	GYG1	P46976	350 aa		27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
UBFD1-208	ENST00000567264	SBF1	O95248	1867 aa		27.89	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		27.88	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.88	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.88	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		27.87	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	ECE2	O60344	883 aa		27.86	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	BCAM	P50895	628 aa		27.86	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.86	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.85	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.85	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		27.85	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		27.85	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	NUCB1	Q02818	461 aa		27.84	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		27.84	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	COL4A5	P29400	1685 aa		27.84	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	CCDC102B	Q68D86	513 aa		27.83	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		27.83	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	LNPK	Q9C0E8	428 aa		27.83	■■■□□ 2.05
UBFD1-208	ENST00000567264	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	PHKA1	P46020	1223 aa		27.82	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		27.82	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	IL1R1	P14778	569 aa		27.81	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		27.8	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	GPATCH3	Q96I76	525 aa		27.8	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		27.8	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	YDJC	A8MPS7	323 aa		27.79	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	FZD9	O00144	591 aa		27.79	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.78	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	CHD4	Q14839	1912 aa		27.78	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	SEMA3E	O15041	775 aa		27.77	■■■□□ 2.04
UBFD1-208	ENST00000567264	RAD17	O75943	681 aa		27.76	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		27.76	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		27.76	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	GTF2I	P78347	998 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	CXCL9	Q07325	125 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	TNIP1	Q15025	636 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		27.75	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.74	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	ZBTB22	O15209	634 aa		27.74	■■■□□ 2.03

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