RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	MAST3	O60307	1309 aa		21.65	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		21.64	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CTAGE5	O15320	804 aa		21.64	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	IL2RB	P14784	551 aa		21.64	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	21.64	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		21.64	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	CBX8	Q9HC52	389 aa		21.64	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		21.64	■■□□□ 1.06
RRN3-205	ENST00000563559	TNS2	Q63HR2	1409 aa		21.64	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	APOBR	Q0VD83	1088 aa		21.64	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	21.64	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		21.64	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		21.64	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	LUZP1	Q86V48	1076 aa		21.63	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	21.63	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		21.63	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	21.63	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	TCIRG1	Q13488	830 aa		21.62	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	GORAB	Q5T7V8	394 aa		21.62	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	21.62	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	ABCC12	Q96J65	1359 aa		21.62	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	CTDNEP1	O95476	244 aa		21.62	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	21.62	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		21.62	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	21.61	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF165	P49910	485 aa		21.61	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	EVC	P57679	992 aa		21.61	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		21.61	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	21.61	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	21.61	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	BRINP3	Q76B58	766 aa		21.61	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	SPC24	Q8NBT2	197 aa		21.61	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		21.61	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		21.6	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		21.6	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	21.59	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		21.59	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		21.59	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559		M0R2C6	588 aa		21.59	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	21.59	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	21.59	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	21.59	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		21.59	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	21.58	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	21.58	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		21.58	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	OSBP2	Q969R2	916 aa		21.58	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	XAGE2	Q96GT9	111 aa		21.58	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	21.58	■■□□□ 1.05
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	21.58	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		21.58	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		21.58	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	21.58	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM5	Q9C035	493 aa		21.58	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF75D	P51815	510 aa		21.57	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		21.57	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		21.57	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	WASHC4	Q2M389	1173 aa		21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	DRC7	Q8IY82	874 aa		21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	CSF1R	P07333	972 aa		21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	STX1A	Q16623	288 aa		21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	APPBP2	Q92624	585 aa		21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	21.56	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		21.55	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	CDC25B	P30305	580 aa		21.55	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		21.55	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	USP28	Q96RU2	1077 aa		21.55	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		21.55	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		21.55	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	STARD3NL	O95772	234 aa		21.54	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		21.54	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	21.54	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		21.54	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JLW4	131 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	PTGS1	P23219	599 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	ADORA1	P30542	326 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	ME1	P48163	572 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	SARM1	Q6SZW1	724 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	RGS22	Q8NE09	1264 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	FGA	P02671	866 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	CHST3	Q7LGC8	479 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	NCOA7	Q8NI08	942 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		21.53	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		21.52	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	EVA1C	P58658	441 aa		21.52	■■□□□ 1.04
RRN3-205	ENST00000563559	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		21.52	■■□□□ 1.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms