RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 C1QL4Q86Z23 238 aa6.6□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 SIX5Q8N196 739 aa6.6□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.6□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 FAM168AQ92567 244 aa6.6□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 CFPP27918 469 aa6.59□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 ATP11AP98196 1134 aa6.59□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 DGKZQ13574 1117 aa6.59□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.59□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 OGFOD1Q8N543 542 aa6.59□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 ALG2Q9H553 416 aa6.59□□□□□ -1.35
FAM227B-211ENST00000560557 EPHA1P21709 976 aa6.58□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 RXRBP28702 533 aa6.58□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 ADMP35318 185 aa6.58□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 PLCL1Q15111 1095 aa6.58□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 CEP135Q66GS9 1140 aa6.58□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.58□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.58□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa6.57□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 TOX2Q96NM4 488 aa6.57□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.57□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.57□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.57□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.56□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 FAM84AQ96KN4 292 aa6.56□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 USP17L3A6NCW0 530 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 USP17L4A6NCW7 530 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 MCM6Q14566 821 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 NFKBIBQ15653 356 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 ZAR1Q86SH2 424 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.55□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 MEGF11A6BM72 1044 aa6.54□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 FAM170BA6NMN3 283 aa6.54□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 PAOXQ6QHF9 649 aa6.54□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.54□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.54□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.54□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 NLRP12P59046 1061 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 SPRED2Q7Z698 418 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 GATA6Q92908 595 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 ADAM19Q9H013 955 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.53□□□□□ -1.36
FAM227B-211ENST00000560557 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.52□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 OR13H1Q8NG92 308 aa6.52□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 ZMYND15Q9H091 742 aa6.52□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 TIAF1O95411 115 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 IGFBP4P22692 258 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 RAP1GAPP47736 663 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 NLRP13Q86W25 1043 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 WNT8BQ93098 351 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 COG6Q9Y2V7 657 aa6.51□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 H3BRJ5 948 aa6.5□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 PIP4K2BP78356 416 aa6.5□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 SPACA7Q96KW9 195 aa6.5□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.5□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.5□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 LGR5O75473 907 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 SEC13P55735 322 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 HYAL2Q12891 473 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 ECM1Q16610 540 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 MYO19Q96H55 970 aa6.49□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 TSPAN15O95858 294 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 PTPRAP18433 802 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 TREML1Q86YW5 311 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 POM121Q96HA1 1249 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 PBX4Q9BYU1 374 aa6.48□□□□□ -1.37
FAM227B-211ENST00000560557 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms