RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 SLFN5Q08AF3 891 aa40.91■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 GMLQ99445 158 aa40.91■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 KCNJ4P48050 445 aa40.9■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 SAPCD2Q86UD0 394 aa40.9■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 FOXN1O15353 648 aa40.89■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 USP17L8P0C7I0 530 aa40.89■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 EPHA10Q5JZY3 1008 aa40.89■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 CYP4F22Q6NT55 531 aa40.89■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 TXNRD3Q86VQ6 643 aa40.89■■■■■ 4.14
TTC7B-202ENST00000553948 GRM1Q13255 1194 aa40.88■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 WBP1LQ9NX94 342 aa40.88■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 CCER2I3L3R5 266 aa40.87■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC57Q2TAC2 916 aa40.87■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 FBXW7Q969H0 707 aa40.86■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 GGA3Q9NZ52 723 aa40.86■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 KLRK1P26718 216 aa40.85■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 DLK2Q6UY11 383 aa40.85■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 TAF7LQ5H9L4 462 aa40.84■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 DACT2Q5SW24 774 aa40.84■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 STRIP1Q5VSL9 837 aa40.84■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 SSH1Q8WYL5 1049 aa40.84■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 HHIPL1Q96JK4 782 aa40.84■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 MYOZ2Q9NPC6 264 aa40.84■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 PTPRCP08575 1304 aa40.84■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 THSD7BQ9C0I4 1608 aa40.83■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 ADM5C9JUS6 153 aa40.83■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 SULF1Q8IWU6 871 aa40.83■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 TNS4Q8IZW8 715 aa40.83■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 CDCA7LQ96GN5 454 aa40.83■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 TAF5LO75529 589 aa40.82■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 SCARF1Q14162 830 aa40.82■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 MYO3BQ8WXR4 1341 aa40.81■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 A0A1B0GUL6 1792 aa40.81■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa40.8■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 MXD3Q9BW11 206 aa40.8■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 SUCLG2Q96I99 432 aa40.79■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 UTYO14607 1347 aa40.78■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 SNAP23O00161 211 aa40.78■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 TTLL5Q6EMB2 1281 aa40.78■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 OGFOD1Q8N543 542 aa40.78■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 CNNM1Q9NRU3 951 aa40.78■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 MAP2K2P36507 400 aa40.76■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 ALDH1L2Q3SY69 923 aa40.76■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 KAZALD1Q96I82 304 aa40.76■■■■■ 4.12
TTC7B-202ENST00000553948 HUNKP57058 714 aa40.75■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 C2orf69Q8N8R5 385 aa40.75■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 CD209Q9NNX6 404 aa40.75■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 PRDM10Q9NQV6 1147 aa40.75■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 IRS2Q9Y4H2 1338 aa40.74■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 AOC2O75106 756 aa40.74■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 GTF2IP78347 998 aa40.74■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 PLIN1O60240 522 aa40.73■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 BEGAINQ9BUH8 593 aa40.73■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa40.72■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 MMP14P50281 582 aa40.72■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 SMC4Q9NTJ3 1288 aa40.72■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF804AQ7Z570 1209 aa40.71■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 CDCA5Q96FF9 252 aa40.71■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 LBX1P52954 281 aa40.7■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
TTC7B-202ENST00000553948 NBPF9Q3BBW0 867 aa40.68■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 HDAC9Q9UKV0 1011 aa40.68■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 KIAA0825Q8IV33 1275 aa40.67■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 WNT10BO00744 389 aa40.65■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 IL1R1P14778 569 aa40.65■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 NOGQ13253 232 aa40.64■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 RGMBQ6NW40 437 aa40.64■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 ANKRD44Q8N8A2 993 aa40.64■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 USP44Q9H0E7 712 aa40.64■■■■■ 4.1
TTC7B-202ENST00000553948 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 UBE4AQ14139 1066 aa40.62■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 SASH1O94885 1247 aa40.61■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa40.61■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 CERS5Q8N5B7 392 aa40.6■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 MROH5Q6ZUA9 1318 aa40.6■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC102AQ96A19 550 aa40.59■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 FKBP1BP68106 108 aa40.57■■■■■ 4.09
TTC7B-202ENST00000553948 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
TTC7B-202ENST00000553948 CA12O43570 354 aa40.56■■■■■ 4.08
TTC7B-202ENST00000553948 CAPN15O75808 1086 aa40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms