RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	TTC16	Q8NEE8	873 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	NACC1	Q96RE7	527 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	NDUFB5	O43674	189 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	FURIN	P09958	794 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	GATA4	P43694	442 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	ORC1	Q13415	861 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	ITGB7	P26010	798 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	CDC27	P30260	824 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	CDC25B	P30305	580 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	DOC2B	Q14184	412 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	OSMR	Q99650	979 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	C9orf172	C9J069	976 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	WISP1	O95388	367 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	EDN3	P14138	238 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	PTPRA	P18433	802 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	USP21	Q9UK80	565 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	ADAM23	O75077	832 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	NOS3	P29474	1203 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	PMEPA1	Q969W9	287 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	METTL12	A8MUP2	240 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	ADAM11	O75078	769 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	MUC3B	Q9H195	1237 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876		H3BRJ5	948 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	FSCN2	O14926	492 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	KCNA1	Q09470	495 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	TMC7	Q7Z402	723 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RBM23-208	ENST00000553876		A0A1W2PP55	124 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876		F8W735	103 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	ALX3	O95076	343 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	PDE3B	Q13370	1112 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	TCF12	Q99081	682 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876		Q6ZS46	218 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	CCNJL	Q8IV13	435 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM23-208	ENST00000553876	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		7.44	□□□□□ -1.22

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