RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGAP4P98171 946 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 ATP11AP98196 1134 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 GJD3Q8N144 294 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.94□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 PHACTR2O75167 634 aa8.93□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 ELNP15502 786 aa8.93□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.93□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 NACC1Q96RE7 527 aa8.93□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 PBX4Q9BYU1 374 aa8.93□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 CHRDQ9H2X0 955 aa8.93□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 PROCP04070 461 aa8.92□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 FBXO11Q86XK2 927 aa8.92□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.92□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 C9orf172C9J069 976 aa8.91□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 SELPP16109 830 aa8.91□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.91□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 EREGO14944 169 aa8.9□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 NDUFB5O43674 189 aa8.9□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 GATA4P43694 442 aa8.9□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.9□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.9□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.9□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 PPME1Q9Y570 386 aa8.9□□□□□ -0.98
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.89□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 TRPA1O75762 1119 aa8.89□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 MUC3BQ9H195 1237 aa8.89□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.89□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.89□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 ACPPP15309 386 aa8.88□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 CDC27P30260 824 aa8.88□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 PDE3BQ13370 1112 aa8.88□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 TMC1Q8TDI8 760 aa8.88□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 CITED4Q96RK1 184 aa8.88□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 LINC01387J3KSC0 135 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 NFKBIEO00221 500 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 EDN3P14138 238 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 PTPRAP18433 802 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 CDC25BP30305 580 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 OSMRQ99650 979 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 USP21Q9UK80 565 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa8.87□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 FAM177BA6PVY3 158 aa8.86□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 DOC2BQ14184 412 aa8.86□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 SETDB1Q15047 1291 aa8.86□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.86□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 ADAM19Q9H013 955 aa8.86□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.86□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 DLL1O00548 723 aa8.85□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 NEFLP07196 543 aa8.85□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 ADGRE1Q14246 886 aa8.85□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.85□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 HHIPQ96QV1 700 aa8.85□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 KCNA1Q09470 495 aa8.84□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 MBTPS1Q14703 1052 aa8.84□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.84□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 NXPE3Q969Y0 559 aa8.84□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 FAM129BQ96TA1 746 aa8.84□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.84□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
ATXN3-218ENST00000553309 CHD1O14646 1710 aa8.83□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 FURINP09958 794 aa8.83□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.83□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.83□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.83□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.83□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 EPHA1P21709 976 aa8.82□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.82□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.82□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 FSCN2O14926 492 aa8.81□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 CABP4P57796 275 aa8.81□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 ORC1Q13415 861 aa8.81□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.81□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.81□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.81□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.81□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.81□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.8□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.8□□□□□ -1
ATXN3-218ENST00000553309 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms