RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 A0A0G2JLW4 131 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 M0R2C6 588 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 SPATA5Q8NB90 893 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 MED23Q9ULK4 1368 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 MAST3O60307 1309 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 POTEAQ6S8J7 498 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 PDRG1Q9NUG6 133 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 JAG2Q9Y219 1238 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 APPP05067 770 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 SERPINB2P05120 415 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 KLRK1P26718 216 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 HAND2P61296 217 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ZNF827Q17R98 1081 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 SLC10A5Q5PT55 438 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 CYP21A2P08686 494 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 SSFA2P28290 1259 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 MSL1Q68DK7 614 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 PRR5LQ6MZQ0 368 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 LRRC2Q9BYS8 371 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 HELLSQ9NRZ9 838 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 WWC3Q9ULE0 1092 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 CARMIL3Q8ND23 1372 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ADRA2BP18089 450 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 MCM2P49736 904 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 FGD1P98174 961 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 LRP2BPQ9P2M1 347 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 AK9Q5TCS8 1911 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 RUFY3Q7L099 469 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 NHSQ6T4R5 1651 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 GPAA1O43292 621 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 PSMA5P28066 241 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 CHST3Q7LGC8 479 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 APPBP2Q92624 585 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 LARGE1O95461 756 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 TM4SF1P30408 202 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 DDIT3P35638 169 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 STK3Q13188 491 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 NECAB1Q8N987 351 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 TTC14Q96N46 770 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 PDE6AP16499 860 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ST5P78524 1137 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 DDR1Q08345 913 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 TXNRD3Q86VQ6 643 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 NEK1Q96PY6 1258 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ADD2P35612 726 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 MAP3K12Q12852 859 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 STK11IPQ8N1F8 1099 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 AIDAQ96BJ3 306 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 CHAMP1Q96JM3 812 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 RAI14Q9P0K7 980 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 COL4A1P02462 1669 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 RTL9Q8NET4 1388 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 FGAP02671 866 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 UBE4AQ14139 1066 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 PLSCR1O15162 318 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 RGL2O15211 777 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 STOX1Q6ZVD7 989 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 C4BP0C0L5 1744 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-215ENST00000549143 PPFIA3O75145 1194 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms