RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	XAGE2	Q96GT9	111 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	SAMM50	Q9Y512	469 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	POTEB2	H3BUK9	544 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	FSBP	O95073	299 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	ECEL1	O95672	775 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	PYGL	P06737	847 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	RUFY3	Q7L099	469 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	KIAA1328	Q86T90	577 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	KAT14	Q9H8E8	782 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	MYOM2	P54296	1465 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		9.03	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	ZSCAN12	O43309	604 aa		9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	RAB27A	P51159	221 aa		9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	CDR1	P51861	262 aa		9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	IFNK	Q9P0W0	207 aa		9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	RAB21	Q9UL25	225 aa		9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.96
ZNF438-208	ENST00000538351	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	PPFIA2	O75334	1257 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	IRAK1	P51617	712 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	KCNB1	Q14721	858 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC96	Q2M329	555 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	RILPL2	Q969X0	211 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	PREX2	Q70Z35	1606 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	LARGE1	O95461	756 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	PRPH	P41219	470 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	EHD4	Q9H223	541 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	MYO6	Q9UM54	1294 aa		9.02	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	MAFG	O15525	162 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM163B	P0C2L3	166 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	PDE1A	P54750	535 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	VSNL1	P62760	191 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	E2F5	Q15329	346 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	GBP3	Q9H0R5	595 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	PIK3R4	Q99570	1358 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	ABCD1	P33897	745 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	STK31	Q9BXU1	1019 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	ANO10	Q9NW15	660 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	ABCC4	O15439	1325 aa		9.01	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC8A3	P57103	927 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	SNCB	Q16143	134 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	SCLT1	Q96NL6	688 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	IL16	Q14005	1332 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	SETSIP	P0DME0	302 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	PDHB	P11177	359 aa		9	□□□□□ -0.97
ZNF438-208	ENST00000538351	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		9	□□□□□ -0.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms